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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000218`

染色体: Chr02 坐标: 2845929-2851125 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000218`
名称	SmilChr02G000218
描述	transcription initiation factor IIE subunit alpha-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2845929 - 2851125 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012624`
GeneID	`131012624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012624`
原始查询	`SmilChr02G000218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor IIE subunit alpha-like
产物	transcription initiation factor IIE subunit alpha-like
Arabidopsis	`AT1G03280` (AT1G03280) Transcription factor TFIIE, alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838581] identity=61.3; qcov=0.896; evalue=6.45e-177; confidence=high
Rice	`Os08g0343300` - identity=62; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0001113 (transcription open complex formation at RNA polymerase II promoter); GO:0005673 (transcription factor TFIIE complex); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02002 (TFIIE_alpha)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796594.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796594.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796594.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796594.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796594.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2848910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,D2
`Chr2:2849411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B129,B57,C13
`Chr2:2849451`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr2:2849451`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr2:2850072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C60
`Chr2:2850135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A2,A6,B129,B57,B94,C27,C3,C30,C86
`Chr2:2850141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B129,C13
`Chr2:2850261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:2850749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A24,B105,B106,B111,B113,B118,B120,B123,B13,B132,B15,B20,B24,B27,B29,B32,B45,B5,B51,B55,B57,B62,B78,B80,B87,B88,B93,B97,B98,C11,C23,C38,C41,C44,C48,C52,C54,C60,C63,C67,C69,C80,C9,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796594.1

473 aa

236

473

TFIIE_alpha

PF02002 TFIIE_alpha 41-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796594.1`	Pfam	`PF02002`	TFIIE_alpha	Domain	41	95	4.8e-08	33.5	TFIIE alpha subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940611.1
TGTATTTTCCGCATTAAACTCCCAAATTTCCACCAGCGATCGCAGATCGCACCATCGAAGGAATTCTAATTCCGCCAAATCCAAATCCCTAAATCCCCAAATCCGAAGCGGCATCCATTGATCCACGACGTCCTATTTGGAATCCTGAGCCGCAGCCATTGATATACGCCGTCTTATTCGGAACCGGTAGCCTTATTCTCGTAGCCATCAATCACTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTTTCGGAGGGTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012624
ATGGCTAGCATCGACCCATTCAATCGCCTGGTGAGACTTGCAGCCCGAGCGTTCTATGATGATATAACGACAAAAGGTGAAAACCAGCAGAGGCCTGGGAGAAGTGATAACAGAGGAATTGCTGTGGTCATTCTTGATGCTCTTACTAGACGTCAGTGGACTAAGGAAGAAGATTTGGCTAGGGACTTGAAACTTCACACGAAGCAACTCCGTCGGACTCTGAGATTCTTCGAAGAAGAAAAACTGGTCACTCGTGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796594.1
MASIDPFNRLVRLAARAFYDDITTKGENQQRPGRSDNRGIAVVILDALTRRQWTKEEDLARDLKLHTKQLRRTLRFFEEEKLVTRDHRKETSKSAKMFSAAVAATMDGQKNGRDDEKQKVHTQSYCCLDYSQIYDVVRYRLHRMKKKLKDELESKNTVQEYICPNCNKRYNALDALRLISPYDEYFHCESCNGILVAESDKLAAQEMGDGDDNASRRRLDKLKDMLTKMEVQLKPLIDQLGRVKDLPVPELEGLQAWLLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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