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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000224`

染色体: Chr02 坐标: 2900591-2903540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000224`
名称	SmilChr02G000224
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g22104-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2900591 - 2903540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012632`
GeneID	`131012632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012632`
原始查询	`SmilChr02G000224`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g22104-like
产物	BTB/POZ domain-containing protein At3g22104-like
Arabidopsis	`AT3G22104` (AT3G22104) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821773] identity=39; qcov=1.05; evalue=5.23e-119; confidence=medium
Rice	`Os07g0546400` - identity=37.4; qcov=1.03; evalue=7.35e-90; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796598.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796598.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796598.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796598.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2900771`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B90,C2,C79,C84
`Chr2:2900771`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B90,C2,C79,C84
`Chr2:2900794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B135,B2,C84,D5
`Chr2:2900818`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B13,B131,B31,B85,C30,C38,C57,D4,D9
`Chr2:2900868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:2900951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C37,D11
`Chr2:2901005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:2901009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:2901052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:2901072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr2:2901094`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr2:2901094`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796598.1

503 aa

252

503

NPH3

PF03000 NPH3 166-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796598.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	166	392	3.1e-55	188.4	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940615.1
CTAAACCAACTCCGTTTATCTGCCGTTCTTGCATTTATTTTGATCTCTCCTAGTTTAGTGTTCAACTCAACATGCGCATTTTAACGTAAGTTGCTTCACGCACACTCCTGTCTGAGAAAAACTAGTGTTCGTTTTTGCGCTGATTTGACCCACGCCCACAAAATTCAAGATTTTCACCTTTTCTTCCTCGCCCCTTTTCATTTTCCTCAGCCAAAAAAAATAAAAAAAAAATCGTCTTTTCCCCTTTTTTCATCTCTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012632
ATGGAGGGAAATTGTTATCTTGAAGTGGATGTCAATGGAGAAGAGGTTTTCTTGGTTGATAAGAGAGTTATATCGTCCTATTCGGGAAGGATGAGCAAATTGCTCGGCAAAATGAGGGATGCAACGGGTAATGTGAAGGTGATATTCCACGGCTTCCCCGGCGGCGCGGAGAGTTTTGAGCTGATCACGAGGTTCTGCTACGACAAGGGGAAGGCCGGCATCATCAATGCCTCGAACATCCTTCCCCTCGCCTCAGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796598.1
MEGNCYLEVDVNGEEVFLVDKRVISSYSGRMSKLLGKMRDATGNVKVIFHGFPGGAESFELITRFCYDKGKAGIINASNILPLASAAHFMEIEHLSEQIERSLEEINHWSLSEVVMALKQQQRVGGAVLDKLLSSLVGRIVSCSETSPSSSAASSSGSSCDGIGATWWFEELVALDARVVEMVTRQMALRRLDSGLIIRFLLHYLKSRSASASLDERVGIVEEVVEMLGILDVRCVSCKSLFELLRVVMKVRVSRRCRNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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