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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000226`

染色体: Chr02 坐标: 2945403-2946560 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000226`
名称	SmilChr02G000226
描述	uncharacterized SmilChr02G000226
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2945403 - 2946560 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012634`
GeneID	`131012634`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012634`
原始查询	`SmilChr02G000226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0195100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0195100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0195100` - identity=41.5; qcov=0.56; evalue=1.62e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03017 (Transposase_23); PF26133 (DUF8039)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012634

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796601.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796601.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796601.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796601.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796601.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2945996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:2946003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:2946023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B108,B63,B83,B99,C23
`Chr2:2946023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B63,B83,B99,C23
`Chr2:2946060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B21,B40,B76,C36,C78,C87
`Chr2:2946080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796601.1

116 aa

116

Transposase_23

DUF8039

PF03017 Transposase_23 34-99 aa PF26133 DUF8039 40-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796601.1`	Pfam	`PF03017`	Transposase_23	Domain	34	99	1.1e-12	48.3	TNP1/EN/SPM transposase
`XP_057796601.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	40	112	5e-07	30.8	Domain of unknown function (DUF8039)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940618.1
GTGTTGAAATTACAAGTGTGTGTATACCAGTTTCATATGGAAACATGTCTTATTGTTCTCCAATTTCTACAGCACATCAACTTACATCTCCAAGTCAGTCGTCCAACTCAGTAAATATGGGACACTCTTTTCAGGTTGGGGATGAGGTGCTTTTAAAAAGCTTATTCAATTCTAGAAAAGCTGTGGCAAAAGGTCGTATTCGTAGTGTTGATCCAAATCAAGAAGTTGGAGGAAAACGACTTGGACTACAATGTTGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012634
ATGTCTTATTGTTCTCCAATTTCTACAGCACATCAACTTACATCTCCAAGTCAGTCGTCCAACTCAGTAAATATGGGACACTCTTTTCAGGTTGGGGATGAGGTGCTTTTAAAAAGCTTATTCAATTCTAGAAAAGCTGTGGCAAAAGGTCGTATTCGTAGTGTTGATCCAAATCAAGAAGTTGGAGGAAAACGACTTGGACTACAATGTTGTGAAGTTCAAGTTTCAGTTCCAATAGAATGGGATGAAGAACTGATTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796601.1
MSYCSPISTAHQLTSPSQSSNSVNMGHSFQVGDEVLLKSLFNSRKAVAKGRIRSVDPNQEVGGKRLGLQCCEVQVSVPIEWDEELIRPYSNLSTIGDAIETCIAWPHHLVKVDDLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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