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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000232`

染色体: Chr02 坐标: 2992261-2997983 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000232`
名称	SmilChr02G000232
描述	formin-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2992261 - 2997983 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012640`
GeneID	`131012640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012640`
原始查询	`SmilChr02G000232`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	formin-like protein 3
产物	formin-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G54650` (Fh5) formin homology5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835554] identity=60.7; qcov=0.509; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os07g0545500` (OsSTA198) - identity=49.9; qcov=0.549; evalue=2.22e-154; confidence=medium
GO	GO:0030036 (actin cytoskeleton organization); GO:0045010 (actin nucleation); GO:0051015 (actin filament binding)
KEGG	-
Pfam	PF02181 (FH2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796606.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796606.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796606.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796606.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796606.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2993566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B91,C6,D3
`Chr2:2993661`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr2:2993661`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr2:2993757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:2993777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C67
`Chr2:2994378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C32,C68
`Chr2:2995659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B137,B95,C14,C35
`Chr2:2997274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796606.1

936 aa

468

936

FH2

PF02181 FH2 464-869 aa

XP_057796607.1

933 aa

466

933

FH2

PF02181 FH2 461-866 aa

XP_057796608.1

930 aa

465

930

FH2

PF02181 FH2 458-863 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796606.1`	Pfam	`PF02181`	FH2	Family	464	869	2.9e-109	366.4	Formin Homology 2 Domain
`XP_057796607.1`	Pfam	`PF02181`	FH2	Family	461	866	2.9e-109	366.4	Formin Homology 2 Domain
`XP_057796608.1`	Pfam	`PF02181`	FH2	Family	458	863	2.9e-109	366.3	Formin Homology 2 Domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940624.1
AGTAAGTTTCTTTGTTTCGTCATTGTCTTGTTCATTTCTCCATCTCACCTCCGAATTACATGCAGCATTTCAACGAACAAAACTCCCAACAGAAATTCGATTTCTAACCCAAATCGCTTCTTTTTCCCCCAAAATCCTCTTCACGAATCACATCAAAGAACCCTATCCGATTCACACCACCGTGAATCCGACTCCATTTTCAGATTAACGGCTCAATTTTTTCCCTTTCTTCAGTTTGGGGACCTGAGGAAAAAGGACAT...

XM_057940623.1
GTAAGTTTCTTTGTTTCGTCATTGTCTTGTTCATTTCTCCATCTCACCTCCGAATTACATGCAGCATTTCAACGAACAAAACTCCCAACAGAAATTCGATTTCTAACCCAAATCGCTTCTTTTTCCCCCAAAATCCTCTTCACGAATCACATCAAAGAACCCTATCCGATTCACACCACCGTGAATCCGACTCCATTTTCAGATTAACGGCTCAATTTTTTCCCTTTCTTCAGTTTGGGGACCTGAGGAAAAAGGACATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012640
ATGGGCGCCAGATTTGTGGCCATTTTTATTGTTTTTATCTGTGTTTTTGCAGCGATTGATTCGGATGGAAAGAGGGAATTAGGGGAAAACTCTTTCGACAGCGAAGTTCAGGCCGAGCAAGTTTGGGATTATTGTAGTAAGAAGTTGAAATATAGCACCGAGGCTGCTAAGAACTTAGGTTCAGGTCTATCTCATTCAGCTGTTACAACATACAGTAGCGTCGAATTTGTTTCGAGTTTGTCAGTGAAAAGGACTATACA...

LOC131012640
ATGGGCGCCAGATTTGTGGCCATTTTTATTGTTTTTATCTGTGTTTTTGCAGCGATTGATTCGGATGGAAAGAGGGAATTAGGGGAAAACTCTTTCGACAGCGAAGTTCAGGTTTTCGATCATCATACGGCCGAGCAAGTTTGGGATTATTGTAGTAAGAAGTTGAAATATAGCACCGAGGCTGCTAAGAACTTAGGTTCAGGTCTATCTCATTCAGCTGTTACAACATACAGTAGCGTCGAATTTGTTTCGAGTTTGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796606.1
MGARFVAIFIVFICVFAAIDSDGKRELGENSFDSEVQVFDHHTAEQVWDYCSKKLKYSTEAAKNLGSGLSHSAVTTYSSVEFVSSLSVKRTIQKAIADLPPKERITILKCLRDRKFPLQVLNDEQRILLDECQNLFSGWAGIPRRYLRRKIGMRQVLQTASDSDSASPSSPTSEESESSDIDYPSPFDLDYPSPLDIDYPPVEMKKFTPMASQDSANDNRMYLVGAVIASSMAGIALAALVLFLCVNKDRREDEPKDVQR...

XP_057796607.1
MGARFVAIFIVFICVFAAIDSDGKRELGENSFDSEVQVFDHHTAEQVWDYCSKKLKYSTEAAKNLGSGLSHSAVTTYSSVEFVSSLSVKRTIQKAIADLPPKERITILKCLRDRKFPLQVLNDEQRILLDECQNLFSGWAGIPRRYLRRKIGMRQVLQTASDSDSASPSSPTSEESESSDIDYPSPFDLDYPSPLDIDYPPVEMKKFTPMASQDSANDNRMYLVGAVIASSMAGIALAALVLFLCVNKDRREDEPKDVQR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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