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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000237`

染色体: Chr02 坐标: 3020822-3022040 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000237`
名称	SmilChr02G000237
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3020822 - 3022040 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012643`
GeneID	`131012643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012643`
原始查询	`SmilChr02G000237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 1
产物	leucine-rich repeat extensin-like protein 1
Arabidopsis	`AT3G22070` (AT3G22070) proline-rich family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821769] identity=36.1; qcov=0.3; evalue=6.7e-06; confidence=low
Rice	`Os04g0629400` - identity=55.3; qcov=0.196; evalue=7.66e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28713 (Os04g0629400-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796611.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796611.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796611.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796611.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3020993`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr2:3020993`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr2:3020995`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A21,A3,A7,A8,B108,B127,B135,B15,B23,B32,B36,B38,B39,B55,B59,B6,B65,B67,B69,B77,B83,B85,B93,C13,C15,C16,C17,C22,C33,C36,C51,C58,C62,C78,C79,C80,C81,C83,C85,C86,D11,D5
`Chr2:3021005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:3021071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C64
`Chr2:3021531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B138,C25,C31
`Chr2:3021639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B60,C52,C69
`Chr2:3021647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B75,C46,C63,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796611.1

240 aa

120

240

Os04g0629400-like

PF28713 Os04g0629400-like 92-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796611.1`	Pfam	`PF28713`	Os04g0629400-like	Domain	92	123	2.2e-14	53.7	Os04g0629400-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940628.1
AAAAAAAGGAATAATAATTAATCAAGAAACATCCAAAAATCACAGCTAAACTAACAGCAGTTTCTCTTCTCTCAGTCTCAGATTCCCCTTCAATGGCCTTCACGTGATAGTGCTCACCCACCCCCCTCAATCGTCTCCTTCACTCCACCAATGACCAAAGCCAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAGGTGAAAAAGAAAAGCAGGAAAAATACATACATACAATTCCCAAACAGGAATGCAAAACCACCATTTCCTCCACGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012643
ATGACCAAAGCCAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAGGTGAAAAAGAAAAGCAGGAAAAATACATACATACAATTCCCAAACAGGAATGCAAAACCACCATTTCCTCCACGCATAAATACAAAAAGACACACACACACACACACACACTCACCAGCTCATCATTGCCCCCACAAATTCACAAATGCCTTTCCCCAACTGCAAATTTTGAGCAGAATTCCGCCGCACCAATCGAAACTCGAAAATTTTGGGGACGGAAGAATGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796611.1
MTKAKKKKKKKVKKKSRKNTYIQFPNRNAKPPFPPRINTKRHTHTHTHSPAHHCPHKFTNAFPQLQILSRIPPHQSKLENFGDGRMCYVGKATKIFVFIVAILVITGLVLGFTLLRHHGIRKKSHDCYSDSCAETAPIVFPAPDSNPSSAAPNPSGNSNPPPPPQSESSGSTVPDSPPPPSDNSSPSVPDLSPPPPALTSPPPPMPTVYPPPPAVVSAAPPPAFSPPNPVPAAPGPVNNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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