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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000249`

染色体: Chr02 坐标: 3211379-3216845 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000249`
名称	SmilChr02G000249
描述	peroxisome biogenesis protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3211379 - 3216845 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012653`
GeneID	`131012653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012653`
原始查询	`SmilChr02G000249`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisome biogenesis protein 22-like
产物	peroxisome biogenesis protein 22-like
Arabidopsis	`AT3G21865` (PEX22) peroxin 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821741] identity=65.7; qcov=1.05; evalue=1.2e-125; confidence=high
Rice	`Os04g0629000` - identity=64; qcov=0.876; evalue=1.32e-101; confidence=high
GO	GO:0007031 (peroxisome organization)
KEGG	-
Pfam	PF22978 (HAD_Pex22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796621.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057796621.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057796621.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057796621.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3214899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:3215996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:3216033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796621.1

266 aa

133

266

HAD_Pex22

PF22978 HAD_Pex22 112-263 aa

XP_057796622.1

266 aa

133

266

HAD_Pex22

PF22978 HAD_Pex22 112-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796621.1`	Pfam	`PF22978`	HAD_Pex22	Domain	112	263	1e-46	158.8	Peroxisome biogenesis protein 22, Haloacid dehydrogenase-like domain
`XP_057796622.1`	Pfam	`PF22978`	HAD_Pex22	Domain	112	263	1e-46	158.8	Peroxisome biogenesis protein 22, Haloacid dehydrogenase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940639.1
AAAGAAATCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTCTTTCAGATATCCAAACTAACAAAAATAACAAATTGACCCCTCTGCAGTCTCTCTTTCGATCTGCTATCCTTCGCCACTCTGCAATAAATCATTCTGCTACAAATGCAACTTCAATTTTAGCGCGAGCAACGAGGGTTTCAATCCGTTTTTGATCAATTGGTATAGGCAGAGCTGAAATCTCCGTGAAATCGCGATGGCTGATAATCCCAAGGACGATCTTCTGCAGTTGA...

XM_057940638.1
AAAGAAATCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTCTTTCAGATATCCAAACTAACAAAAATAACAAATTGACCCCTCTGCAGTCTCTCTTTCGATCTGCTATCCTTCGCCACTCTGCAATAAATCATTCTGCTACAAATGCAACTTCAATTTTAGCGCGAGCAACGAGGGTTTCAATCCGTTTTTGATCAATTGGTATAGGCAGAGCTGAAATCTCCGTGAAATCGCGATGGCTGATAATCCCAAGGACGATCTTCTGCAGTTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012653
ATGGCTGATAATCCCAAGGACGATCTTCTGCAGTTGATCAAACGCGTTGGAGCTTTTCTCTCCGTCAAGTTTTCCAATTTCCCCCGCGACCTGGATTCACGATCAGTTGGGGCCATAGCAGGGCTAGCATTTGCTTTAGTGTTTACTTGGAGACTATTGAGAACACCTAGTGAACCTGAAAGAAGGCAATCTAAACGGCCGGCGAGTAGTTCTGGTGTTAGTAGTGCTGAGACAGTGAATGCTTCATCCTCGGGGGCTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796621.1
MADNPKDDLLQLIKRVGAFLSVKFSNFPRDLDSRSVGAIAGLAFALVFTWRLLRTPSEPERRQSKRPASSSGVSSAETVNASSSGASNPSGDSTTQNVIDEFFQPVKPTLGQIVRQRLSEGRKVTCRLLGVILEESTPEELQKQVTVRSSVLEVLLEITKFCDLYLMERVLDDESEKKVLVALEDAGVFTSGGLVKDKVLFCGTENGRTSFVRQLEPDWHIDSNPEITTQLARFIKYQLHVSSVNLERPASNVFTAPSLE...

XP_057796622.1
MADNPKDDLLQLIKRVGAFLSVKFSNFPRDLDSRSVGAIAGLAFALVFTWRLLRTPSEPERRQSKRPASSSGVSSAETVNASSSGASNPSGDSTTQNVIDEFFQPVKPTLGQIVRQRLSEGRKVTCRLLGVILEESTPEELQKQVTVRSSVLEVLLEITKFCDLYLMERVLDDESEKKVLVALEDAGVFTSGGLVKDKVLFCGTENGRTSFVRQLEPDWHIDSNPEITTQLARFIKYQLHVSSVNLERPASNVFTAPSLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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