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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000252`

染色体: Chr02 坐标: 3246865-3248599 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000252`
名称	SmilChr02G000252
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3246865 - 3248599 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007842`
GeneID	`131007842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007842`
原始查询	`SmilChr02G000252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=25.5; qcov=0.835; evalue=2.75e-20; confidence=low
Rice	`Os09g0372900` (OsFbox482) - identity=26.6; qcov=0.696; evalue=1.99e-15; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790739.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790739.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790739.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790739.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3246888`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B7,B71,C11,C37,C72,C8,D10,D5
`Chr2:3247001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C73
`Chr2:3247068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B124,C52,C64,C69
`Chr2:3247068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C52,C64,C69
`Chr2:3247100`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B122,C80
`Chr2:3247100`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B122,C80
`Chr2:3247534`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A16,B107,B113,B130,B27,B45,B69,B81,B84,B9,B90,B92,B93,C35,C36,C72,C76,D3,D4
`Chr2:3247543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B85,C69
`Chr2:3247602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C69
`Chr2:3247607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C69
`Chr2:3247608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:3247614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B20,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790739.1

437 aa

218

437

F-box

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 7-41 aa PF08268 FBA_3 90-351 aa PF07734 FBA_1 116-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790739.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	7	41	8.7e-08	32.5	F-box domain
`XP_057790739.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	90	351	4.9e-30	105.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057790739.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	116	345	2.7e-18	66.8	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934756.1
ATGAAGCCAGATTTCTTCAAAAATCTACCACCAGAAATCATCACCGAGATCTTCTTAAGGCTACCTGCTGTAAGCATTCCAATAAGCAAATGCGTTTGCAAGCGATGGCTCCATCTGCTGGAGCCTGATGATTTTATCGAGTCTCATTTTGCCAGATCCGCTCCGGCCCTAGTTGTTTTGGGGGATTCAGGTGGGTTGAAAGTTTTGGAATTGGAAGGCGAGCTCGATCTCCATCTCGATCCACTCACCCAGTATGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007842
ATGAAGCCAGATTTCTTCAAAAATCTACCACCAGAAATCATCACCGAGATCTTCTTAAGGCTACCTGCTGTAAGCATTCCAATAAGCAAATGCGTTTGCAAGCGATGGCTCCATCTGCTGGAGCCTGATGATTTTATCGAGTCTCATTTTGCCAGATCCGCTCCGGCCCTAGTTGTTTTGGGGGATTCAGGTGGGTTGAAAGTTTTGGAATTGGAAGGCGAGCTCGATCTCCATCTCGATCCACTCACCCAGTATGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790739.1
MKPDFFKNLPPEIITEIFLRLPAVSIPISKCVCKRWLHLLEPDDFIESHFARSAPALVVLGDSGGLKVLELEGELDLHLDPLTQYDFPYHPRKIINCVNGFLILRKCGFGVLMESVDWLCVCNPITREVIKLDLPPLMDSQHPSSEEVVAFGFGASKITGRYKAVIIKSNDYDEESDCHVYTLGTGSWRRLEGIPGVYQFGEGAFVNGNLYWKASIRKEATWISCFDVETECFSFFKAPPYDAQGLPFLRGMCISAMSGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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