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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000262`

染色体: Chr02 坐标: 3409681-3411676 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000262`
名称	SmilChr02G000262
描述	myb family transcription factor PHL8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3409681 - 3411676 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012666`
GeneID	`131012666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012666`
原始查询	`SmilChr02G000262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb family transcription factor PHL8-like
产物	myb family transcription factor PHL8-like
Arabidopsis	`AT3G04030` (MYR2) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819558] identity=76.1; qcov=0.561; evalue=3.59e-17; confidence=low
Rice	`Os03g0325500` - identity=72.5; qcov=0.622; evalue=1.67e-18; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF14379 (Myb_CC_LHEQLE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796637.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057796637.1`
3	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057796638.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057796637.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3409805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:3409813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C80
`Chr2:3409826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,C67,D11,D4,D9
`Chr2:3409827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:3409829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr2:3409972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A21,B107,B127,B130,B38,B55,B58,B69,C14,C17,C23,C37,C38,C77
`Chr2:3410001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B128,C82
`Chr2:3410005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B47,D6
`Chr2:3410067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B95
`Chr2:3410077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B97
`Chr2:3410080`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B47,B79
`Chr2:3410080`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B47,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796637.1

104 aa

104

Myb_CC_LHEQLE

PF14379 Myb_CC_LHEQLE 13-59 aa

XP_057796638.1

82 aa

Myb_CC_LHEQLE

PF14379 Myb_CC_LHEQLE 13-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796637.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	13	59	4.9e-22	78.1	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif
`XP_057796638.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	13	60	2.6e-22	79.0	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940654.1
AAAGTTAACCGGGTCAGTTGACCCGGTATATAAAAAAAATTCATTCTAAGCCCTAACACCTTCGATCTCTGTCTTCCTTTCTCGCTTTTCTCACACTTCAGATCAGCCAAGGAGAAGTCGTCGCCTCTCAAATACTTGGACTTGGCGAGTGCGGTTTCTGCTTGTTTATGAAAGCGGGCGGTTGTAGAGTGATGTTTACGAATTGGGAGAAGTGCGTGTATTAAGGGGAGAAAAACAAGAAGTATATCGTGGAGAAATGT...

XM_057940655.1
AAGTTAACCGGGTCAGTTGACCCGGTATATAAAAAAAATTCATTCTAAGCCCTAACACCTTCGATCTCTGTCTTCCTTTCTCGCTTTTCTCACACTTCAGATCAGCCAAGGAGAAGTCGTCGCCTCTCAAATACTTGGACTTGGCGAGTGCGGTTTCTGCTTGTTTATGAAAGCGGGCGGTTGTAGAGTGATGTTTACGAATTGGGAGAAGTGCGTGTATTAAGGGGAGAAAAACAAGAAGTATATCGTGGAGAAATGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012666
ATGATTATGAGAAGAAGGCAGCTTCTTGATGATAGTGTGCAGATTGCGGAAGCTCTGAGAATGCAGATGGAGGTGCAGAGGAAGCTGGAGCAGAAAATGGAGGTGCAGAGACATTTGCAGCTGAGAATCGAAGCTCAAGGAAGGTACCTGCAGTCGGTGCTCAACAAGGCCAAGGAGACTCAACATCACCTGCTCCACTCCGCCTCGGACCACAGCTCTCTCAGTAAAGCAAAGCAAAAAGACAGTGAAATGAATTATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796637.1
MIMRRRQLLDDSVQIAEALRMQMEVQRKLEQKMEVQRHLQLRIEAQGRYLQSVLNKAKETQHHLLHSASDHSSLSKAKQKDSEMNYAGNRRIFSKEDKGIVCAI

XP_057796638.1
MIMRRRQLLDDSVQIAEALRMQMEVQRKLEQKMEVQRHLQLRIEAQGRYLQSVLNKAKETQHHLLHSASDHSSLSKAKQKVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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