当前解析结果
SmilChr02G000264| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000264 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000264 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000264 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 3422626 - 3423363 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012667 |
|---|---|
| GeneID | 131012667 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012667 |
| 原始查询 | SmilChr02G000264 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012667 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057796639.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057796639.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796639.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796639.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796639.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:3422767 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C46 |
Chr2:3422767 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr2:3422778 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B113,B132,B61,B72,B8,B84,C3,C43,C47 |
Chr2:3422826 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B60,D7 |
Chr2:3422827 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 161 | A1,A10,A11,A14,A15,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A4,A8,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B107,B109,B110,B112,B115,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B125,B128,B131,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B29,B30,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B60,B62,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B82,B84,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C35,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C72,C74,C76,C77,C79,C8,C80,C85,C86,C87,D2,D3,D7 |
Chr2:3422828 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 60 | A10,A11,A2,A21,A25,A4,B1,B102,B105,B109,B115,B123,B128,B137,B19,B20,B22,B24,B28,B30,B32,B33,B36,B38,B39,B42,B43,B52,B54,B60,B62,B64,B68,B74,B77,B86,B9,B90,B92,B97,B98,C1,C14,C15,C19,C2,C22,C26,C45,C53,C55,C61,C62,C63,C74,C76,C8,C80,C85,D3 |
Chr2:3422843 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr2:3422993 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr2:3423008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A19,A21,A4,B102,B125,B21,B52,B7,B95,C27 |
Chr2:3423183 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:3423239 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B94 |
Chr2:3423239 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。