当前解析结果
SmilChr02G000267| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000267 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000267 |
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK10 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 3469154 - 3470115 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007845 |
|---|---|
| GeneID | 131007845 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007845 |
| 原始查询 | SmilChr02G000267 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK10 |
| 产物 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK10 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007845 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790742.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790742.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790742.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790742.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790742.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:3469186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:3469270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,B71 |
Chr2:3469296 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,B36,B63,B81,C76 |
Chr2:3469315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C41,D9 |
Chr2:3469331 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B80,B90,C23 |
Chr2:3469468 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B16 |
Chr2:3469468 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr2:3469482 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr2:3469489 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 28 | A8,B110,B122,B128,B138,B15,B29,B38,B39,B4,B45,B49,B62,B72,B79,B84,B9,B91,B97,B99,C19,C30,C31,C40,C42,C64,C66,C72 |
Chr2:3469501 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,D11 |
Chr2:3469529 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr2:3469572 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B3,B53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。