当前解析结果
SmilChr02G000277| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000277 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000277 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000277 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 3553646 - 3555779 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012679 |
|---|---|
| GeneID | 131012679 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012679 |
| 原始查询 | SmilChr02G000277 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012679 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796653.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057796653.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057796653.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796653.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796653.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:3553835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | A6,B112 |
Chr2:3553835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A6,B112 |
Chr2:3554082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr2:3554097 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B11,B127,B7 |
Chr2:3554213 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 25 | A10,A16,A9,B126,B131,B137,B20,B29,B33,B56,B58,B60,B65,B91,B96,C1,C15,C20,C39,C40,C46,C5,C50,C74,D9 |
Chr2:3554281 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B6,C20,C41 |
Chr2:3554376 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B84,B90,D2 |
Chr2:3554391 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr2:3554401 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B87,C41,C46 |
Chr2:3554420 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A14,A19,B112,B128,B18,B95,C39,C45,D9 |
Chr2:3554422 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B35 |
Chr2:3554782 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B124,B30,B54,C31 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。