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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000288`

染色体: Chr02 坐标: 3673679-3675762 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000288`
名称	SmilChr02G000288
描述	probable membrane metalloprotease ARASP2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3673679 - 3675762 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012686`
GeneID	`131012686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012686`
原始查询	`SmilChr02G000288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable membrane metalloprotease ARASP2, chloroplastic
产物	probable membrane metalloprotease ARASP2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G32480` (ARASP) chloroplastic membrane metallo proteases [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817809] identity=67.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0579000` - identity=59.2; qcov=0.87; evalue=2.35e-152; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006508 (proteolysis); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00595 (PDZ); PF02163 (Peptidase_M50); PF13180 (PDZ_2); PF17820 (PDZ_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796663.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057796663.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057796663.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057796663.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796663.1

454 aa

227

454

Peptidase_M50

PDZ_2

PDZ

PDZ_6

PF02163 Peptidase_M50 98-435 aa PF13180 PDZ_2 210-288 aa PF00595 PDZ 217-273 aa PF17820 PDZ_6 222-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796663.1`	Pfam	`PF02163`	Peptidase_M50	Family	98	435	1.6e-57	195.1	Peptidase family M50
`XP_057796663.1`	Pfam	`PF13180`	PDZ_2	Domain	210	288	1.2e-07	32.6	PDZ domain
`XP_057796663.1`	Pfam	`PF00595`	PDZ	Domain	217	273	2.8e-05	25.1	PDZ domain
`XP_057796663.1`	Pfam	`PF17820`	PDZ_6	Domain	222	277	6.7e-07	29.6	PDZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940680.1
AATGGATGATTCTCTTCACCTCCACAAACTCATAAATTCAAATTATCCATTCAAAATCTACTTAGCTCTCACCTCACACCAACAACAACAAAACTCAATGCCACCTCCATTAAACTTAACTCACTCTTCTTACCAATAATCCTCTCCACAATCATTCACAATGATTGCAACCCTCTCTTCATCTCCTCACCCACTGCCCAGATTCAGCACTTCAAGAACACCCATCTCCGATTTCTCCCCCAATTCCAAAACCCATTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012686
ATGATTGCAACCCTCTCTTCATCTCCTCACCCACTGCCCAGATTCAGCACTTCAAGAACACCCATCTCCGATTTCTCCCCCAATTCCAAAACCCATTTATCTTCTTCACCATGTTCGATAATTTGCAGAGGAAGTCCGTTTCTCTCTTCACCATGTTCGATAATTTGCAGAGGAAGTCCGTTTCTCTTCAGGAGCAGAGGATTGAGGCATAATACGAGGAAAAAGTTTCAAACTTGCGCGATTGGCGGGCTCGATCTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796663.1
MIATLSSSPHPLPRFSTSRTPISDFSPNSKTHLSSSPCSIICRGSPFLSSPCSIICRGSPFLFRSRGLRHNTRKKFQTCAIGGLDLAGFESAQSVIEAAAVLTAIIVVHESGHFFAAYLQGIHVSKFAVGFGPILARFNSKNVEYSIRAFPLGGFVAFPDNDPDSEIPNDDVNLLKNRPIFDRVVVISAGVIANIVFAYVIIFAQVLFVGLPVQESFPGVLVPEVRPFSAASRDGLLPGDVILGVDDIELSRTGPSLVSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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