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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000305`

染色体: Chr02 坐标: 3847713-3851771 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000305`
名称	SmilChr02G000305
描述	uncharacterized SmilChr02G000305
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3847713 - 3851771 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012701`
GeneID	`131012701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012701`
原始查询	`SmilChr02G000305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dentin sialophosphoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28716244]; symbol=AT1G05087; hit=AT1G05087; species=arabidopsis; confidence=low
产物	dentin sialophosphoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28716244]; symbol=AT1G05087; hit=AT1G05087; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G05087` (AT1G05087) dentin sialophosphoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28716244] identity=35.9; qcov=0.418; evalue=9.89e-34; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25122 (DUF7815)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057796675.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057796675.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796675.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796675.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057796675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3847891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:3848049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B34,B44
`Chr2:3848117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr2:3848587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:3848710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:3848742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:3849006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B66,C15,C87
`Chr2:3849028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C40
`Chr2:3849184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B92,C18,C38,C48
`Chr2:3849185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:3849246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A22,C25,C45
`Chr2:3849310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796675.1

612 aa

306

612

DUF7815

PF25122 DUF7815 54-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796675.1`	Pfam	`PF25122`	DUF7815	Domain	54	77	3.1e-10	40.5	Domain of unknown function (DUF7815)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097419.1
TTTTTTTTTTTCCCCCAAAAAAAGGAAAGAAAATCACTGAATAAACGAAAAAACACACACAGAGCAGAGTGACTGTGTGAGATTAGTTTTTGATGAGCGAAAAATGGCCCAAATTCCGTACGAATTGATCCGAGAAGTCCAGATCCGTACCCGGGCAGCGGCGGGGCTGCCCGATTACGACCCGTCGGACCCTACCCTGCCCGCTCTGCCGCCTCTCTCTGCCACGATAGCCGCCGCCGCCGCCGATGCGTCGCCGACGG...

XM_057940692.1
AGGAAAGAAAATCACTGAATAAACGAAAAAACACACACAGAGCAGAGTGACTGTGTGAGATTAGTTTTTGATGAGCGAAAAATGGCCCAAATTCCGTACGAATTGATCCGAGAAGTCCAGATCCGTACCCGGGCAGCGGCGGGGCTGCCCGATTACGACCCGTCGGACCCTACCCTGCCCGCTCTGCCGCCTCTCTCTGCCACGATAGCCGCCGCCGCCGCCGATGCGTCGCCGACGGACCGCCGCTGCCGGAATTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012701
ATGGCCCAAATTCCGTACGAATTGATCCGAGAAGTCCAGATCCGTACCCGGGCAGCGGCGGGGCTGCCCGATTACGACCCGTCGGACCCTACCCTGCCCGCTCTGCCGCCTCTCTCTGCCACGATAGCCGCCGCCGCCGCCGATGCGTCGCCGACGGACCGCCGCTGCCGGAATTGCAAAGCATTGCTCCTTAGAGGACCGGAGTCCATCGTCTGCTTGTACTGCGGCATCGGCCCCCATTACGACGCCGTTCCGGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796675.1
MAQIPYELIREVQIRTRAAAGLPDYDPSDPTLPALPPLSATIAAAAADASPTDRRCRNCKALLLRGPESIVCLYCGIGPHYDAVPDPIRFTSTVGYQWLLRSLHLDGSELVDPTSKINQGKVQSSPKDLTPLSAFLNFKIPWPAENEISSDKNLDEGKRSLVLTGVAPDRFFLKSKSNGVSDTPVEQPSDDKWAEVDTAKDVAALGNQDLFQNVQSSKPSVSSSEHTTSRALSGWEADFQSADSENQLGGHTSSEHVVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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