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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000308`

染色体: Chr02 坐标: 3886515-3887161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000308`
名称	SmilChr02G000308
描述	dirigent protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3886515 - 3887161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012704`
GeneID	`131012704`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012704`
原始查询	`SmilChr02G000308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 22-like
产物	dirigent protein 22-like
Arabidopsis	`AT2G21100` (AT2G21100) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816645] identity=34; qcov=0.857; evalue=1.79e-26; confidence=low
Rice	`Os12g0174700` - identity=35.6; qcov=0.834; evalue=3.85e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012704

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057796678.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057796678.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796678.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796678.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3886538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B71,C13,D10
`Chr2:3886592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:3886685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:3886692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B28
`Chr2:3886696`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	63	A19,A24,A7,B104,B106,B107,B108,B110,B113,B121,B126,B130,B139,B140,B16,B18,B19,B22,B23,B25,B28,B32,B34,B37,B49,B50,B51,B57,B6,B60,B62,B66,B68,B79,B81,B84,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B96,B97,C1,C13,C14,C2,C26,C28,C29,C32,C35,C41,C42,C52,C64,C68,C71,C72,C75,D8,D9
`Chr2:3886701`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A19,A24,A7,B104,B106,B107,B108,B110,B113,B121,B126,B128,B130,B139,B140,B16,B18,B19,B22,B23,B25,B28,B32,B34,B37,B49,B50,B51,B57,B6,B60,B62,B66,B68,B79,B81,B84,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B96,B97,C1,C13,C14,C2,C26,C28,C29,C32,C35,C41,C42,C52,C64,C68,C71,C72,C75,D8,D9
`Chr2:3886717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:3886768`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A1,A11,A2,A22,A3,A4,A5,B104,B105,B115,B117,B12,B120,B125,B130,B133,B135,B16,B19,B2,B3,B31,B32,B47,B6,B66,B69,B7,B70,B88,B9,B90,B92,B99,C13,C16,C27,C32,C34,C42,C44,C46,C48,C5,C51,C58,C59,C62,C64,C65,C68,C7,C71,C72,C73,C87,D3,D4,D5
`Chr2:3886791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:3886826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:3886849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr2:3886873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796678.1

175 aa

175

Dirigent

PF03018 Dirigent 30-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796678.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	30	172	2.8e-38	131.6	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940695.1
TAAGCTTCAATTTAAAGGTTATGGCATCCAATAAACTCACATTAGCTTTACTCCTCTTTCTCGCCATCTTCACATATGCAAAGGCAAAGCGAGGCCATCTCAAGGAGACCAAAATGTCGGTCTACTATCAAGACTACTCCGGCGATCGGAACACGACCGTGATCGAGATCCCGGGCCCGTCGACGGGACCTCTGAACTTCTCCAAGTTCGGAGCCATGTTCGTCACGGACGACCCAATCACCGAAGAAATTGGAGAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012704
ATGGCATCCAATAAACTCACATTAGCTTTACTCCTCTTTCTCGCCATCTTCACATATGCAAAGGCAAAGCGAGGCCATCTCAAGGAGACCAAAATGTCGGTCTACTATCAAGACTACTCCGGCGATCGGAACACGACCGTGATCGAGATCCCGGGCCCGTCGACGGGACCTCTGAACTTCTCCAAGTTCGGAGCCATGTTCGTCACGGACGACCCAATCACCGAAGAAATTGGAGAAGGCTCGGCCCTAATCGCAAGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796678.1
MASNKLTLALLLFLAIFTYAKAKRGHLKETKMSVYYQDYSGDRNTTVIEIPGPSTGPLNFSKFGAMFVTDDPITEEIGEGSALIARGRGLAVTTALDGSNAHLLLSVVFIDGDYKGSTLELQGSDPQFEQVREVAVVGGTGKFRLARGYATFETLSYDPVRGHAVIQSNMTLLHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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