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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000339`

染色体: Chr02 坐标: 4347520-4350214 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000339`
名称	SmilChr02G000339
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02750-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4347520 - 4350214 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012767`
GeneID	`131012767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012767`
原始查询	`SmilChr02G000339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02750-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02750-like
Arabidopsis	`AT4G02750` (AT4G02750) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828187] identity=48.3; qcov=0.588; evalue=1.08e-18; confidence=low
Rice	`Os08g0162200` (P0577B11.133) - identity=34.5; qcov=0.764; evalue=4.28e-10; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057796772.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057796772.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796772.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796772.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4349156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B55
`Chr2:4349159`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A1,A2,A22,B100,B103,B113,B130,B136,B16,B55,B69,C36,C46,C74
`Chr2:4349160`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B55,B69
`Chr2:4349160`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B55,B69
`Chr2:4349666`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A4,B11,B114,B119,B133,B137,B140,B19,B25,B35,B37,B71,C18,C34,C77,C9
`Chr2:4349772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B70,B93,C47,C76
`Chr2:4349859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:4349964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:4349965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796772.1

148 aa

148

PPR

PF01535 PPR 53-72 aa PF01535 PPR 75-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796772.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	53	72	2.1e-08	34.6	PPR repeat
`XP_057796772.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	75	104	2.1e-08	34.6	PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097429.1
CCCTAAAATGAACGCTGCGCCACCAAATTCCTCTCTCCCCCAAAGCTTTTTCCAGCCCCTCAAATTCCGCCGCCGCATCTCTGTGCCTCCCTCGCAGCCACCGTCGTCAGCTTATCGTTTTCCATGGTAGCTGCGCGCGAATTTCACCCCCAATCAAATTTTTTATAACGAGCCGAACGCGAGCTCAAATTGAGCCGATTTTTGGAACGAGCCGATCTGGAGCCAGCATCTCTCATCTCATGCTTTTCACCAACTCTAAT...

XM_057940789.1
CCCTAAAATGAACGCTGCGCCACCAAATTCCTCTCTCCCCCAAAGCTTTTTCCAGCCCCTCAAATTCCGCCGCCGCATCTCTGTGCCTCCCTCGCAGCCACCGTCGTCAGCTTATCGTTTTCCATGGTAGCTGCGCGCGAATTTCACCCCCAATCAAATTTTTTATAACGAGCCGAACGCGAGCTCAAATTGAGCCGATTTTTGGAACGAGCCGATCTGGAGCCAGCATCTCTCATCTCATGCTTTTCACCAACTCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012767
ATGCTTTTCACCAACTCTAATGCTCAGGGTGAAAAGCCGCCGCGTCGGAATTCTAGCCACCTCTTTGAACCACCGGCCAATAATCCGCCGGCTAGGCCGAGAAGCAACGAATTTACGGATTCCGACATAGTGATATGCAACGTCTCTATCAGAGATCACTTGCGCGGTGGCCGATTCGACGCTGCGTTGCGCTTGTTCAACTCGATGCGTCGCAAATCTGCGGTATCGTATGGCATCTTGATGTTTGGGTGCTTGTCCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796772.1
MLFTNSNAQGEKPPRRNSSHLFEPPANNPPARPRSNEFTDSDIVICNVSIRDHLRGGRFDAALRLFNSMRRKSAVSYGILMFGCLSSGEFKLAHQLFDKMAVKNLVAGNMMICGNIKNKNLAAARRQVWKHQGGIAKTWLCRSSSPTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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