当前解析结果
SmilChr02G000352| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000352 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000352 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000352 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 4531258 - 4532840 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012757 |
|---|---|
| GeneID | 131012757 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012757 |
| 原始查询 | SmilChr02G000352 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012757 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057796745.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057796745.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796745.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796745.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796745.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:4532179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr2:4532198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B61,B76,C17,C51 |
Chr2:4532198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B61,B76,C17,C51 |
Chr2:4532209 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr2:4532219 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B122,B24,B53 |
Chr2:4532219 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B122,B24,B53 |
Chr2:4532231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,B98 |
Chr2:4532267 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B24,B29,B53,C20,C41 |
Chr2:4532285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr2:4532301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B139,C10,C34 |
Chr2:4532352 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B23,B29,B90 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。