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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000356`

染色体: Chr02 坐标: 4594628-4601151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000356`
名称	SmilChr02G000356
描述	fimbrin-5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4594628 - 4601151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012720`
GeneID	`131012720`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012720`
原始查询	`SmilChr02G000356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fimbrin-5
产物	fimbrin-5
Arabidopsis	`AT5G35700` (FIM5) fimbrin-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833544] identity=75.2; qcov=0.918; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0719100` - identity=69.6; qcov=0.955; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005884 (actin filament); GO:0032432 (actin filament bundle); GO:0051015 (actin filament binding); GO:0051017 (actin filament bundle assembly); GO:0051639 (actin filament network formation)
KEGG	-
Pfam	PF00307 (CH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012720

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057796697.1`
2	Cell projection	细胞突起	1.00000	`XP_057796697.1`
3	Ruffle	Ruffle	1.00000	`XP_057796697.1`
4	Pseudopodium	Pseudopodium	0.60000	`XP_057796697.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4595653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr2:4595776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B140
`Chr2:4595842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C48
`Chr2:4596584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:4597525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr2:4598091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:4598114`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B28,B88
`Chr2:4598114`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B28,B88
`Chr2:4598190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:4600625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4600685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B40,C25,C47
`Chr2:4600688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796697.1

686 aa

343

686

PF00307 CH 154-236 aa PF00307 CH 268-369 aa PF00307 CH 394-496 aa PF00307 CH 517-618 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796697.1`	Pfam	`PF00307`	CH	Domain	154	236	1.3e-80	267.4	Calponin homology (CH) domain
`XP_057796697.1`	Pfam	`PF00307`	CH	Domain	268	369	1.3e-80	267.4	Calponin homology (CH) domain
`XP_057796697.1`	Pfam	`PF00307`	CH	Domain	394	496	1.3e-80	267.4	Calponin homology (CH) domain
`XP_057796697.1`	Pfam	`PF00307`	CH	Domain	517	618	1.3e-80	267.4	Calponin homology (CH) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940714.1
AAAATAGAATTTGGAGGTAGTTGTTAGTTGTGTTGTGCTCCCTGAGTATTCGCAGGTCCGTAAGCCGAAACGGCAATTTCTCCATCATATCCTCTTTTTTCATTTTCATTTCCATTTCCACTTCCATTTCTATTGTCATTCTCAACTCTTGATCCCAATCACACGCACTGATACTACAAATAAATGAACAAGAGATGGCATGGGGTTGATCATTTTCTGTGTAAACGTTAGATATCATCACTGATTCCACTCATCATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012720
ATGTCCAGTTTCGTGGGTGTAATCGTCTCTGATCCTTGGCTTCAGAGCCAATTCACTCAAGTCGAGCTGCGAGGCCTTAAATCTAAGTTTCTCTCGGCAAGGAACCAATCTGGGAAGGTTACATTAGCAGATTTGCCGCCAGTATTGGCGAAATTGAAGGCGGTTACTGAATTGTTAACAGAGGATGAGGTCAGGGACATCTTAAGGGAGGAGTCTTCTGATTTGGACCAAGAAGTTGATTTTGAATCCTTCCTTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796697.1
MSSFVGVIVSDPWLQSQFTQVELRGLKSKFLSARNQSGKVTLADLPPVLAKLKAVTELLTEDEVRDILREESSDLDQEVDFESFLKHYLNLQARASAKVGGSKTSSSFLKATTTTLRHTISESEKASYVAHINSCLGDDPFLKDYLPLDPSSDAIFELAKDGVLLCKLINVAVAGTIDERAINTKKVLNPWERNENHTLCLNSAKAIGCTVVNIGTQDLVEARPHLVVGLMSQIIKIQLLSDLDLKKTPQLVELVEDTKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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