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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000358`

染色体: Chr02 坐标: 4615882-4618242 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000358`
名称	SmilChr02G000358
描述	6,7,8-trihydroxycoumarin synthase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4615882 - 4618242 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012733`
GeneID	`131012733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012733`
原始查询	`SmilChr02G000358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	6,7,8-trihydroxycoumarin synthase-like
产物	6%2C7%2C8-trihydroxycoumarin synthase-like
Arabidopsis	`AT4G31500` (CYP83B1) cytochrome P450, family 83, subfamily B, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829277] identity=39.6; qcov=1.02; evalue=1.25e-122; confidence=medium
Rice	`Os12g0268000` (sl) - identity=33.7; qcov=1.01; evalue=1.61e-83; confidence=low
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057796712.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057796712.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796712.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796712.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4615974`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	124	A1,A14,A19,A21,A22,A25,A5,A6,A8,B10,B100,B102,B104,B105,B108,B11,B112,B113,B114,B118,B121,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B138,B15,B16,B17,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B4,B46,B49,B52,B54,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B64,B69,B70,B73,B76,B79,B81,B84,B87,B88,B89,B91,B93,B94,B97,B98,C1,C11,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C29,C3,C30,C32,C33,C35,C4,C43,C44,C46,C47,C48,C53,C55,C56,C58,C60,C61,C63,C65,C67,C68,C69,C7,C72,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D5,D7
`Chr2:4616010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,D3
`Chr2:4616046`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B7
`Chr2:4616046`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B7
`Chr2:4616050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr2:4616148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:4616203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B10,B74
`Chr2:4616245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B58,B62,B68,C28,C71
`Chr2:4616251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B58,B62,B68,C28,C71
`Chr2:4616413`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	51	A18,A19,A22,A6,A8,B100,B102,B108,B127,B130,B131,B132,B28,B3,B32,B37,B38,B39,B52,B54,B58,B62,B68,B69,B70,B73,B84,B86,B94,C1,C11,C15,C23,C28,C29,C3,C30,C4,C51,C55,C61,C63,C67,C69,C71,C75,C78,C81,C83,C85,C86
`Chr2:4616417`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A18,A19,A22,A6,A8,B100,B102,B108,B127,B130,B131,B132,B28,B3,B32,B37,B38,B39,B52,B54,B58,B62,B68,B69,B70,B73,B84,B86,B94,C1,C11,C15,C23,C28,C29,C3,C30,C4,C51,C55,C61,C63,C67,C69,C71,C75,C78,C81,C83,C85,C86
`Chr2:4616428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796712.1

496 aa

248

496

p450

PF00067 p450 34-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796712.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	34	481	1.4e-91	308.3	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940729.1
TAGTATATATATACATATATATATGTATAGATCTTCCCAGAAGGCAAATCAAACTAGATAAGCGAAGATGAATACACTTATAGTGATGATGATTATTATTTTGGTAATCACAGTGATGCTTATAAGGACGACGAGGAAGAAGAAGAAGAATAAACCCCTAGCCGCGGGGCCTCGAGGGGTCCCGCTGCTAGGAAACTTGCTTCAATTCGACAAATCCAACACCCTCTCATACCTCCAAAAGCTATCTCACAACTACGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012733
ATGAATACACTTATAGTGATGATGATTATTATTTTGGTAATCACAGTGATGCTTATAAGGACGACGAGGAAGAAGAAGAAGAATAAACCCCTAGCCGCGGGGCCTCGAGGGGTCCCGCTGCTAGGAAACTTGCTTCAATTCGACAAATCCAACACCCTCTCATACCTCCAAAAGCTATCTCACAACTACGGCCCCGTCGCCCTCCTCCGGCACGGCTCCACCCCGATCCGGGTGGTTTCCTCGGCGGCGCTAGCCAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796712.1
MNTLIVMMIIILVITVMLIRTTRKKKKNKPLAAGPRGVPLLGNLLQFDKSNTLSYLQKLSHNYGPVALLRHGSTPIRVVSSAALAKQILKTHDNKPSVLGQQKLSYGGADIAFSPHNPHWKEMRRLCALHLFSPAKLASFRPVREAQVARMMATLQARCSAANLSELAMSLASNIICGVAFGRTYDDDEYEKKKLDKLVLEAQALMVSFYFSDHLRVFSWVDKLSGLLGRLDTNFDELDAFYQQLIDEHIHASSSQINSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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