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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000362`

染色体: Chr02 坐标: 4652574-4656739 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000362`
名称	SmilChr02G000362
描述	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4652574 - 4656739 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012738`
GeneID	`131012738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012738`
原始查询	`SmilChr02G000362`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma-like
Arabidopsis	`AT1G04170` (EIF2 GAMMA) eukaryotic translation initiation factor 2 gamma subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839238] identity=87.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0607100` - identity=91.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000049 (tRNA binding); GO:0001731 (formation of translation preinitiation complex); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0005850 (eukaryotic translation initiation factor 2 complex); GO:0045903 (positive regulation of translational fidelity)
KEGG	-
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF03144 (GTP_EFTU_D2); PF09173 (eIF2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796719.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796719.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057796719.1`
4	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057796719.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057796719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4652720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:4652732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B34,C16,C41
`Chr2:4652744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:4653135`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	79	A1,A10,A11,A14,A20,A21,A3,A7,B101,B109,B112,B113,B114,B121,B124,B13,B138,B139,B17,B18,B20,B21,B25,B27,B29,B30,B34,B35,B37,B42,B43,B45,B46,B47,B50,B61,B67,B69,B71,B75,B76,B8,B81,B82,B83,B84,B89,B90,B91,B92,B97,B98,B99,C11,C15,C16,C18,C20,C22,C30,C31,C36,C39,C41,C43,C44,C48,C5,C58,C6,C64,C66,C69,C70,C76,C8,C86,D5,D6
`Chr2:4653150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B20,B91
`Chr2:4653818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr2:4653912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C7
`Chr2:4654999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B139,B24,B31,D4
`Chr2:4655562`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	166	A11,A14,A18,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B113,B114,B117,B119,B120,B122,B124,B125,B127,B13,B131,B132,B133,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B50,B51,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C2,C21,C22,C23,C24,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C42,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C56,C58,C6,C60,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C79,C80,C82,C83,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796719.1

464 aa

232

464

GTP_EFTU

GTP_EFTU_D2

eIF2_C

PF00009 GTP_EFTU 32-236 aa PF03144 GTP_EFTU_D2 268-350 aa PF09173 eIF2_C 362-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796719.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	32	236	1e-26	94.4	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057796719.1`	Pfam	`PF03144`	GTP_EFTU_D2	Domain	268	350	5.6e-09	37.0	Elongation factor Tu domain 2
`XP_057796719.1`	Pfam	`PF09173`	eIF2_C	Domain	362	451	7.3e-32	110.2	Initiation factor eIF2 gamma, C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940736.1
AGAAAAAATTTAAATTTTTAGGGTTGCCGCACTCACCTCAGATCCTTCTCCCCCATCGTCTTCCACAGTTCCATTGCAGAGGAAACCCTAAATGCTCTTAAACCTCCAACACACTGCACTGCACTGAACAAAGAGGTACGAACTCGAGGCTTCTTTCGATCCGAACAACAATAAAAAGTAATTTCTGGGTGGCGGATTCGAAGGAGGCTATTTTAAGAAGAATCTTCCAAGAACCCTGGATTGCCTATGGTTCAATAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012738
ATGTCGAGGAAGGGCTTGATGGAGCAGGATTTAAGCAAGCTGGATGTAACAAAACTAAATCCACTATCGCCTGAGGTGATTTCTCGCCAGGCCACCATTAACATTGGCACCATTGGGCATGTGGCTCATGGGAAGTCTACAGTTGTGAAGGCCATCTCTGGTGTCCAGACCGTTCGCTTTAAAAATGAACTGGAACGTAATATTACTATCAAGCTTGGGTATGCCAATGCCAAGATATACAAGTGTGAAGAGGATCGATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796719.1
MSRKGLMEQDLSKLDVTKLNPLSPEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVQTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKCEEDRCPRPMCYKAYGSGKEDSPMCDVPGFENCRMKLLRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAIMDGALLLIAANESCPQPQTSEHLAAVEIMRLQHIIILQNKVDLVQENVAINQHEAIQRFIQGTVADGAPVVPISAQLKYNIDVVCEYIVKKIPIPERNFTSPPNMIVIRSFDVNKPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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