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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000375`

染色体: Chr02 坐标: 4745987-4748861 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000375`
名称	SmilChr02G000375
描述	probable glycosyltransferase At3g07620
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4745987 - 4748861 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012731`
GeneID	`131012731`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012731`
原始查询	`SmilChr02G000375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase At3g07620
产物	probable glycosyltransferase At3g07620
Arabidopsis	`AT3G07620` (AT3G07620) glycosyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819953] identity=65.2; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0188700` - identity=54.1; qcov=0.987; evalue=2.74e-153; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012731

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057796710.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057796710.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796711.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796711.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4746036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C25
`Chr2:4746158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B62,C3,C63,C67
`Chr2:4746167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:4746168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:4746220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:4746260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:4746291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D3
`Chr2:4746299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C25
`Chr2:4746345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:4746375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:4746468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B84,C29,C30,C33,C87
`Chr2:4746474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796710.1

507 aa

254

507

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 175-457 aa

XP_057796711.1

399 aa

200

399

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 67-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796710.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	175	457	2.3e-57	195.3	Exostosin GT47 domain
`XP_057796711.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	67	349	1.4e-57	196.0	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940727.1
ACCTAGGATTTCTCTTGTAACTGAAAAAACAAAGAAGAAGACAAAGTCACACAACACAGAGCCAATGATGGGTGTTGTTGAAGGTTTGTGTAGAGTTAAAGGCTTCACTAAATCTCAATGCATCCAAATTCTTGCTTTCACAGCTTTAGCCATAGCTTTCTTGGCTCTCTTCACTAACACATCCACAAATCTCTCTCTCTCCTCTCTCCCATCTCTCCCATGGGCATGGAACCCTTCTTCCTTCTCCGCCTCCTCCTCCG...

XM_057940728.1
TCTCTCCCATCTCTCCCATGGGCATGGAACCCTTCTTCCTTCTCCGCCTCCTCCTCCGCCCCTCCACCACCGCCGCCGCCTCCGCCGACGACCAAGAATCCCAACATGGCTTTCTACCCTACCTTCACTGTATAAAATCCCAAAAGGCAGAAGGTTGTTGAGAAATTAGTGAAAGAGTTGAATGAAGAAACGATGAGAAGAAGAGGAATGGAAAGAGACAAAAATATGGGCAAAATAGAAGCGGATCTCGCTACGGCGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012731
ATGATGGGTGTTGTTGAAGGTTTGTGTAGAGTTAAAGGCTTCACTAAATCTCAATGCATCCAAATTCTTGCTTTCACAGCTTTAGCCATAGCTTTCTTGGCTCTCTTCACTAACACATCCACAAATCTCTCTCTCTCCTCTCTCCCATCTCTCCCATGGGCATGGAACCCTTCTTCCTTCTCCGCCTCCTCCTCCGCCCCTCCACCACCGCCGCCGCCTCCGCCGACGACCAAGAATCCCAACATGGCTTTCTACCCTAC...

LOC131012731
ATGAGAAGAAGAGGAATGGAAAGAGACAAAAATATGGGCAAAATAGAAGCGGATCTCGCTACGGCGAGAGCGCTGATCAAAGATGCGATTTTTAAGAGTCGCGATTCTCCTCCACTTGCACAAGACGCAGATTATGTGCCTCGAGGAAAAATCTATAGGAATTCTTATGTTTTCCAAAGGAGTTACATGTTAATGGAGAAGATTATGAAAATATACGTATATTCAGAAGGCGAGGCCCCTTTGTTCCACTATGGGCCCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796710.1
MMGVVEGLCRVKGFTKSQCIQILAFTALAIAFLALFTNTSTNLSLSSLPSLPWAWNPSSFSASSSAPPPPPPPPPTTKNPNMAFYPTFTNPKRQKVVEKLVKELNEETMRRRGMERDKNMGKIEADLATARALIKDAIFKSRDSPPLAQDADYVPRGKIYRNSYVFQRSYMLMEKIMKIYVYSEGEAPLFHYGPTKNIYSTEGIFIGLIESKSSHNLRTEDPNQAHLYFLPFSVVMILQHLFDPVERDKAVLERVIGDYV...

XP_057796711.1
MRRRGMERDKNMGKIEADLATARALIKDAIFKSRDSPPLAQDADYVPRGKIYRNSYVFQRSYMLMEKIMKIYVYSEGEAPLFHYGPTKNIYSTEGIFIGLIESKSSHNLRTEDPNQAHLYFLPFSVVMILQHLFDPVERDKAVLERVIGDYVAIISDKYPYWNRSLGADHFMLSCHDWGPRATWCVHHLYFTSIRALCNANTSEFFNPRKDVSFPEINLPTGDISGLTTTGSPNRTVLAFFAGRLHGKIRPSIFKHWKDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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