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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000380`

染色体: Chr02 坐标: 4770260-4772275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000380`
名称	SmilChr02G000380
描述	uncharacterized SmilChr02G000380
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4770260 - 4772275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012729`
GeneID	`131012729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012729`
原始查询	`SmilChr02G000380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826882]; symbol=AT4G12700; hit=AT4G12700; species=arabidopsis; confidence=high
产物	calcium ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826882]; symbol=AT4G12700; hit=AT4G12700; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G12700` (AT4G12700) calcium ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826882] identity=54.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0456400` - identity=46.1; qcov=1.12; evalue=7.1e-179; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF23269 (DUF7074); PF23272 (DUF7075)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057796708.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796708.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796708.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796708.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4770540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C2,C48,D7
`Chr2:4770638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C30,D2
`Chr2:4770768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A9,B32,B49
`Chr2:4770903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B40,B66,C78
`Chr2:4771005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B9,C52,C87
`Chr2:4771149`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A1,A18,A21,B104,B120,B130,B27,B28,B34,B40,B66,C6,C64,C66,C78,D11
`Chr2:4771151`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A1,A18,A21,B104,B120,B130,B27,B28,B34,B40,B66,C6,C64,C66,C78,D11
`Chr2:4771158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:4771159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:4771223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:4771446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C42,C53
`Chr2:4771497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796708.1

540 aa

270

540

DUF7074

DUF7075

PF23269 DUF7074 118-203 aa PF23272 DUF7075 233-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796708.1`	Pfam	`PF23269`	DUF7074	Domain	118	203	3.2e-36	124.2	Domain of unknown function (DUF7074)
`XP_057796708.1`	Pfam	`PF23272`	DUF7075	Domain	233	525	2.4e-79	267.2	Domain of unknown function (DUF7075)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940725.1
TTTTCTGTTATCGACTATTGATAGTAATTTATAGGCAATCTTCAGATTTTGACTCGCGCCACTTTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACAGCTGATCCATAAATACAGATTCTGTCTCTAGAGCCCTGCTTCATCTTCAATGGTGGAGCTCCAAAATCTCTCTCTAAGTTTGAATGAAATTGAGCTCAAGGGAAACATGTTGCGCCGCTCTCCGTTTAAGCGCCCCGAAAATGTCGGCCAGAATTCGCTAGTCATGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012729
ATGGTGGAGCTCCAAAATCTCTCTCTAAGTTTGAATGAAATTGAGCTCAAGGGAAACATGTTGCGCCGCTCTCCGTTTAAGCGCCCCGAAAATGTCGGCCAGAATTCGCTAGTCATGATCGCAAGCCTCTGTTTCAGTGTCTTCGTAACCGCGGTCGTGATTTTCACCATAATCGCCGCGACCTACAATTCCGACGACGCCTTCCTCCATCCCGTCTCGGAGATCGCGGATTTCCTCTCGCCGGAGGCGGATTCGACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796708.1
MVELQNLSLSLNEIELKGNMLRRSPFKRPENVGQNSLVMIASLCFSVFVTAVVIFTIIAATYNSDDAFLHPVSEIADFLSPEADSTDPAGFIDTSDVESAVAEAGFTEFSESRGCRADEPINCRDLEVFHLMMRAAIDRFKDVHFYRFGKPVEGDNGSSCHMAWRFRPKEGKATGFNKDYRSFRVLRFGNCTLGVVGIGEYHSGGNARKRKGKGKIPSIAMDNLEKTVESEESFSHGKYLVYAGGGERCKSMSHYMWSFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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