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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000381`

染色体: Chr02 坐标: 4772304-4773854 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000381`
名称	SmilChr02G000381
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4772304 - 4773854 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012749`
GeneID	`131012749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012749`
原始查询	`SmilChr02G000381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=27.2; qcov=0.507; evalue=3.44e-08; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=27.4; qcov=0.433; evalue=1.13e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796735.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796735.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796735.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796735.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4772577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B80,C14,C34
`Chr2:4772724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B140
`Chr2:4772760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:4772772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:4772773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B121
`Chr2:4772773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr2:4772786`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr2:4772786`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr2:4772885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B131,C2,D7
`Chr2:4772947`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A10,A13,A16,A6,B11,B138,B14,B140,B15,B26,B27,B29,B30,B31,B33,B47,B70,B94,B99,C17,C26,C39,C4,C53,C55,C56,C59,C70,C74,C79,C8,D3
`Chr2:4773071`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B122,B2,C3,C47,C7
`Chr2:4773071`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B122,B2,C3,C47,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796735.1

363 aa

182

363

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 31-221 aa PF07734 FBA_1 46-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796735.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	31	221	1.6e-17	64.2	F-box associated beta propeller domain
`XP_057796735.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	46	204	1.5e-15	57.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940752.1
TCCCTATTGTTGAGATTTATAAAACCGTAGCTTCTTCCCAAATCGATTAACCGTTTTTCAAATCAAAAGCCAATCCTATCGCGTCTTCTTTCCTCAAAGCTAAGAAATCGACAAAGCTTCTCCACCCAAAGATAGTTCGTCAGAGACGAGAGGTTATCATTAACCCTTTTGCAGAATGGATGGTTTTGTTTTGAAACGCTATCATGCCGATGGTGGCGATAGGCATTATTTATCTTTATTTTTTGGGCAAGATTGGTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012749
ATGGATGGTTTTGTTTTGAAACGCTATCATGCCGATGGTGGCGATAGGCATTATTTATCTTTATTTTTTGGGCAAGATTGGTCTAACTGTGAAAATATAGTGCTTCCATTCTCTAAAAATTCTCGTATCCATGGTAGTAGTTGTGGTGGATTATTTTATTTTGACAATTTGAAAGGTAGGATTATAATTTGTAATCCAACCACCAAAACTTTCAAATCTCTTGATCCACCCAAGATGCTTAACCCTCCAAATATGACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796735.1
MDGFVLKRYHADGGDRHYLSLFFGQDWSNCENIVLPFSKNSRIHGSSCGGLFYFDNLKGRIIICNPTTKTFKSLDPPKMLNPPNMTTFHSSGFGYDRISDDYKVVSLFSHNYCRDMDYYSDYDVVAKAEVFSLKRGSWKEINSHVDLCSELRYGWDTHMNGIYINGVCYWSTDEYTIRSFDFTDECFSSFELPVNNIDDDDELSFKYDLIKVNDMLGVFFHENFPPLGPDCFGFSTTFELLVRKEGSWVPLYNVNLCDIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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