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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000386`

染色体: Chr02 坐标: 4804307-4806175 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000386`
名称	SmilChr02G000386
描述	oxygen-evolving enhancer protein 2-1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4804307 - 4806175 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012752`
GeneID	`131012752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012752`
原始查询	`SmilChr02G000386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxygen-evolving enhancer protein 2-1, chloroplastic-like
产物	oxygen-evolving enhancer protein 2-1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G06680` (PSBP-1) photosystem II subunit P-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837178] identity=73.9; qcov=0.827; evalue=5.58e-138; confidence=high
Rice	`Os07g0141400` (PsbP) - identity=68.3; qcov=0.827; evalue=2.16e-113; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796739.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057796739.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057796739.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796739.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4804549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4804609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C44
`Chr2:4804624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B26,B88
`Chr2:4804777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C72
`Chr2:4805078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C74,D8
`Chr2:4805799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr2:4805867`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A18,A3,B100,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B115,B120,B124,B126,B128,B131,B133,B16,B19,B46,B48,B5,B53,B64,B7,B72,B78,B80,B85,B86,B88,B93,B97,C14,C16,C2,C25,C28,C31,C45,C48,C49,C62,C65,C70,C71,C75,C82,D2,D7
`Chr2:4805875`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A18,A2,A3,A4,A6,A8,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B12,B120,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B135,B16,B17,B19,B22,B25,B30,B37,B40,B46,B48,B5,B53,B54,B55,B60,B61,B64,B66,B7,B70,B71,B72,B75,B78,B80,B82,B83,B85,B86,B88,B93,B97,B98,C1,C14,C16,C2,C25,C28,C30,C31,C32,C42,C45,C48,C49,C5,C51,C53,C55,C62,C65,C68,C70,C71,C72,C75,C76,C78,C82,D11,D2,D7
`Chr2:4805911`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	169	A1,A10,A11,A14,A18,A19,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B127,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B139,B15,B17,B18,B2,B20,B21,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B44,B47,B49,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B69,B70,B76,B77,B79,B8,B81,B84,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C19,C20,C21,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C33,C34,C36,C38,C40,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C52,C54,C56,C57,C59,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C72,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D5,D6,D8,D9
`Chr2:4805973`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C74,D8
`Chr2:4805973`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C74,D8
`Chr2:4805989`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	84	A13,A22,A3,A6,A8,B101,B112,B114,B115,B120,B127,B132,B136,B137,B14,B140,B16,B17,B19,B22,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B38,B39,B45,B54,B58,B59,B6,B60,B64,B68,B7,B71,B74,B78,B80,B82,B86,B95,B99,C1,C12,C13,C14,C16,C17,C20,C25,C27,C28,C31,C39,C41,C43,C46,C48,C49,C53,C55,C56,C58,C59,C6,C62,C67,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C81,C82,C83,C86,D10,D11,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796739.1

324 aa

162

324

PsbP

PF01789 PsbP 155-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796739.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	155	323	4.6e-37	128.2	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940756.1
ATGATAATTATTTGTTGGAAAGAGATGATTGAAGATTAAAAAAAAAAAATAGAAAACATTTTGTAATAAGATTGAGAAGTGGGCCCCAACCCCAAAACCATCCGACGTGGAGATTTCAAGAAACAGTTGGCATGAAGAAAGACCACCACAGCCTTATCCATCCATCACGAAATCTAATCCAAAAAATCAAAACTCCACCATTCAGAATCACACATCACACACACTACACATTCAAGAAAAAGGGTGTGAGTGTGTGTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012752
ATGAAGAAAGACCACCACAGCCTTATCCATCCATCACGAAATCTAATCCAAAAAATCAAAACTCCACCATTCAGAATCACACATCACACACACTACACATTCAAGAAAAAGGGTGTGAGTGTGTGTATTTTTTGGATCCTCAATTTCTCAGAAACAAAGAAAAAAAACCAAGAAAAAGATATGGCGTCGACTGCATGCTTCTTGCACCACCACGCGGCGCTCTCCACCTCGGCGAGAACCACCTCCAGCCGCCACGCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796739.1
MKKDHHSLIHPSRNLIQKIKTPPFRITHHTHYTFKKKGVSVCIFWILNFSETKKKNQEKDMASTACFLHHHAALSTSARTTSSRHAPSLKPAQQLVCRAQKQAENQESDGGAAVSRRLALTLLVGAAAVATKVSPADAAYGESANIFAKPKSNTDFKPYAGDGFKVLVPAKWNPSSEVEFPGTVLRYEDNFDATSNLTVTINPTDKKSITDYGSPEDFLSQVDYLLGKQAYFGKTDSEGGFDSGAVATANLLETATPVVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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