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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000389`

染色体: Chr02 坐标: 4816764-4820556 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000389`
名称	SmilChr02G000389
描述	uncharacterized SmilChr02G000389
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4816764 - 4820556 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012748`
GeneID	`131012748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012748`
原始查询	`SmilChr02G000389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0147700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os07g0147700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G30540` (AT1G30540) Actin-like ATPase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839934] identity=67; qcov=0.881; evalue=7.3e-158; confidence=high
Rice	`Os07g0147700` - identity=74.8; qcov=0.868; evalue=1.3e-173; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01869 (BcrAD_BadFG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796734.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796734.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796734.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796734.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4817298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C32
`Chr2:4817376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C32,C68
`Chr2:4819023`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr2:4819023`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr2:4819047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:4819053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:4819101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr2:4819455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C39,C43
`Chr2:4819782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:4819835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:4819844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,C16,C49,C62,C75
`Chr2:4819862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796734.1

371 aa

186

371

BcrAD_BadFG

PF01869 BcrAD_BadFG 44-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796734.1`	Pfam	`PF01869`	BcrAD_BadFG	Family	44	356	3e-53	181.8	BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940751.1
CACACGCCACGTGGACTGCAGCCAATAACATGGTTTCGCAGCAAAGGCAAATCGCACAACGACAAAGAGCTCATTGCATGCAGAGCTAAGCAAAAATGGCTGCCTCTTTCATCGAATACTTTATCTGCATTCCTCCAATCAACATCCCCAATTATTCAATTACTATGCAGACTCGTCGATTTCACCTAAAATCAAGCACTTACCTCCAAGAATTTGTCTCCTTGTTGCCGTCCCAATTCTTTATTTACGAAAACCCCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012748
ATGAAGAGGTATAGGAATCGGCAAATTTGGGAGTTTGAGCATGAAGTGAATATGATGGCTGCTGCAGCTGCTGCTTATAGGGATGAAGGTAGGATTTTGAATGGTGGTGTTTATGGGAGGAAGGTGATATTGGGGATAGATGGTGGGACGGCGTCGACTGTTTGCATATGCATGTCTTTGACACCCTTTGATCAGCCGCTGCCTGATCCTCTGCCTGTTCTTGCTCGCGCCGTCGCCGGTTGCTCCAACCACAACAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796734.1
MKRYRNRQIWEFEHEVNMMAAAAAAYRDEGRILNGGVYGRKVILGIDGGTASTVCICMSLTPFDQPLPDPLPVLARAVAGCSNHNSVGESAARETLEKVMADALAASRSTRSSVQAVCLSASGVDHPKDQHRILTWLREIFPSHVRLFVENDAVAALSSGTMGKLHGCVLIAGTGTIAYGFTEDGREARAAGAGPVLGDWGSAYGIAAQALTAVIRAYDGRGPPTTLTQIILDKLNLSSPDELIGWTYADPSWARIAALL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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