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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000397`

染色体: Chr02 坐标: 4915364-4916889 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000397`
名称	SmilChr02G000397
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4915364 - 4916889 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012750`
GeneID	`131012750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012750`
原始查询	`SmilChr02G000397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=25.2; qcov=0.927; evalue=1.36e-09; confidence=low
Rice	`Os05g0116600` (Os_F0617) - identity=31.4; qcov=0.354; evalue=1.77e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796736.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057796736.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796736.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796736.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4915494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C12,C20
`Chr2:4915585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C25
`Chr2:4915632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:4915789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:4915803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr2:4915847`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr2:4915847`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr2:4915942`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A1,A24,B101,B34,B52,B66,B75,B78,B83,C27,C53,C75,C83,C86
`Chr2:4915946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D7
`Chr2:4915947`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	93	A13,A16,A2,A21,A22,A3,A5,A6,A8,B103,B108,B109,B110,B113,B114,B118,B121,B122,B124,B13,B130,B131,B138,B139,B17,B18,B19,B22,B27,B28,B33,B37,B38,B39,B41,B44,B45,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B58,B61,B70,B75,B77,B81,B83,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C18,C19,C25,C3,C31,C32,C36,C38,C41,C48,C50,C54,C59,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C71,C74,C78,C81,C84,D3,D8,D9
`Chr2:4915951`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	87	A13,A16,A2,A21,A22,A3,A5,A8,B103,B108,B109,B110,B113,B114,B118,B121,B122,B124,B13,B130,B131,B138,B139,B17,B18,B19,B22,B27,B28,B33,B37,B39,B41,B44,B45,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B61,B70,B75,B77,B81,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C18,C19,C25,C32,C36,C38,C41,C48,C50,C54,C59,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C71,C74,C78,C81,C84,D3,D8,D9
`Chr2:4916104`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A16,A3,B108,B121,B124,B19,B28,B53,B83,B90,B92,B98,C1,C11,C15,C16,C32,C61,C68,C69,C78,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796736.1

342 aa

171

342

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 28-233 aa PF07734 FBA_1 45-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796736.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	28	233	1.4e-21	77.5	F-box associated beta propeller domain
`XP_057796736.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	45	196	4e-18	66.2	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940753.1
TTCAGATTTATAAAAACCCTTTCGTTCAAATCAAAAGCCAATCCTCAAAGCTAAGAAATCGACAAAGCTTCCCCACCCAAAGATAGTTCGTCTTGCAGAATGGATGGTTTTCTTTTGAAACGCAAACATGCGGATGGTGGCAATAGGCATTATTTATCTTTATTTTCTGGGCAAGAAAATCATGAAAGTATAGTGCTTCCCTTCTCTAAAAATTCTTATGTCGATGGTAGTGGTTGTGGTGGGTTATTGTATTTTGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012750
ATGGATGGTTTTCTTTTGAAACGCAAACATGCGGATGGTGGCAATAGGCATTATTTATCTTTATTTTCTGGGCAAGAAAATCATGAAAGTATAGTGCTTCCCTTCTCTAAAAATTCTTATGTCGATGGTAGTGGTTGTGGTGGGTTATTGTATTTTGACAATTTTAAAGGTAGGATTATAATTTCCAATCCAACCACCAAAACTTTCAAATCTCTTGATCCACCCAAGATGCCAAACCCTCCAAATATAACAATTTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796736.1
MDGFLLKRKHADGGNRHYLSLFSGQENHESIVLPFSKNSYVDGSGCGGLLYFDNFKGRIIISNPTTKTFKSLDPPKMPNPPNITIFSGSGLGYDRISDDYKVVRLFTHCPAIFSPRDFHNKAEVFSLKRGSWKEINSHVDGCTGFTNSMSGIYINGVCYWSANGYTIISFDFADERFSSFDLPVSNLYDHRNNLIKVNDMLGVFRQQKPLQFSTGFELLVRKEGSWVPWCNVHLCDIVRPLLLNEGQFLFLEKQLNLRHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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