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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000405`

染色体: Chr02 坐标: 5017529-5022524 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000405`
名称	SmilChr02G000405
描述	protein PAT1 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	5017529 - 5022524 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012792`
GeneID	`131012792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012792`
原始查询	`SmilChr02G000405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PAT1 homolog 2-like
产物	protein PAT1 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT4G14990` (AT4G14990) Topoisomerase II-associated protein PAT1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827158] identity=51.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0517300` - identity=50.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000290 (deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA); GO:0000932 (P-body); GO:0003723 (RNA binding); GO:0033962 (P-body assembly)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796777.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796777.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057796777.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057796777.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057796777.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:5018227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:5020333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:5020527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C87
`Chr2:5020551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C14,C5
`Chr2:5020782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:5020825`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A23,A24,A25,B102,B111,B112,B120,B126,B129,B13,B139,B15,B16,B18,B21,B24,B27,B32,B33,B36,B42,B50,B51,B52,B54,B61,B62,B77,B78,B83,B86,C10,C12,C15,C16,C19,C2,C20,C23,C25,C29,C39,C41,C51,C66,C72,D11,D4
`Chr2:5020983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:5021055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C24
`Chr2:5021262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:5021298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B80,C34
`Chr2:5021358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:5021373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C15

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940794.1
AAACACGTCCCAACAAATGAACTATCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCACTCTATATATATATATGTATATATAACAGAGACAAATCCAGACACACTTTATTATATACGCACAAAAAATATTACTTTCTCTCTCTAGAAAAAACACACACACACGCACATACAAATATAGAATCGAGTCTAACCGCTCACTGTGTGAACTGTGTGAATATCTCAGTGGGTTGAGTCTTTGTCTTGTCTGCTGCTAAAACCCTAATTGCGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012792
ATGGAGAGATCCGACGGCAAGGATTTCAACGACTTCACCGACTTCTCCAGCAGCTCGGCTTCTGGTAGTGCGATGTTTGACGCGTCCCAGTATGCCTTCTTCGGTAAGGAGGCAATGGATGAAGTGGAATTGGGGGGTTTGGAGGATGATGAAGAGGTTGTACGTTCGATTGGGGGAGGATTTTGTGGTGAAGAGGAATTGAATGAGTATCATTTGTTCCAGAAAGACGAGGGCTCAGGAGTAGGATCTTTGTCTGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796777.1
MERSDGKDFNDFTDFSSSSASGSAMFDASQYAFFGKEAMDEVELGGLEDDEEVVRSIGGGFCGEEELNEYHLFQKDEGSGVGSLSDIDDLATTFAKLNKVVSGPRHPGVIGDRGSGSFSRESSSATEWTRDTDFPEWFDHHMSDSECYEENKRWSSQPHLSSMFLSESKPLYRTSSYPQQQPQLLHASSEPILPPKSSFTSFPPPGSQKTSFNLSSLSSGPQSPFSAQNNSLLSNSTLNWSSLPVGFQYNANMNLMSPNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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