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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000408`

染色体: Chr02 坐标: 5049985-5053905 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000408`
名称	SmilChr02G000408
描述	polyamine oxidase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	5049985 - 5053905 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012795`
GeneID	`131012795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012795`
原始查询	`SmilChr02G000408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyamine oxidase 2-like
产物	polyamine oxidase 2-like
Arabidopsis	`AT2G43020` (PAO2) polyamine oxidase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818904] identity=78.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0623300` (PAO3) - identity=72.3; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005777 (peroxisome); GO:0006598 (polyamine catabolic process); GO:0046592 (polyamine oxidase activity)
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01593 (Amino_oxidase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057796785.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796785.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057796785.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057796785.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796785.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:5051046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:5052224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C74
`Chr2:5052684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B83,C67,D2
`Chr2:5052692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:5052810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B64,C74,D8
`Chr2:5052826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:5052880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr2:5052985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:5052990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B32
`Chr2:5053211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C52
`Chr2:5053417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C51
`Chr2:5053473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B84,C29,C30,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796785.1

491 aa

246

491

FAD_binding_2

NAD_binding_8

Amino_oxidase

PF00890 FAD_binding_2 30-73 aa PF13450 NAD_binding_8 32-88 aa PF01593 Amino_oxidase 37-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796785.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	30	73	7.2e-09	36.0	FAD binding domain
`XP_057796785.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	32	88	1.2e-14	55.1	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057796785.1`	Pfam	`PF01593`	Amino_oxidase	Domain	37	456	2.5e-92	311.2	Flavin containing amine oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940802.1
AGAAACTACCTAACTTTTTCCATCTCTCTCCTCTCAAAAAAATCCTTACTTCATCTCTCTTCAATCTCTCATTCATCATCGCAGCAATTTCTCCCCGCAAATTCCAACTGTTTTTGTTCCAAATTCGTTGAAAATTTGAGTAGCTAGGAGAAGCTGCGGAGCTCAACAATTTCATCACTTCCGTCATCCATTACTCTCAAACATATCCCTTTCCATTGTCCCCTTCAGCTGCTGAGCTGCTGCAGAATTAGTATTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012795
ATGGAGTCGAGGAATAAGGGCAGTCGCCAGCTCGAAAGAGCTGTTTGCTATTCAAACTTTGAGAGGAAGTCTATGGCATCGCCATCTGTTATTGTTATAGGTGCCGGTTTTGCCGGCATTGCAGCTGCACGAGCTCTACATGATGCGGAATTTCAGGTAGTTGTGCTCGAATCACGTGATAGAATAGGTGGAAGAGTGCACACCGACTATTCTTTTGGTTTCCCAGTTGATTTGGGTGCTTCATGGTTACATGGTGTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796785.1
MESRNKGSRQLERAVCYSNFERKSMASPSVIVIGAGFAGIAAARALHDAEFQVVVLESRDRIGGRVHTDYSFGFPVDLGASWLHGVCKENPLAPVIGRLGLPLYRTSGDNSVLYDHDLESYALFDMDGEQVSPDLVAKVGETFESILKETELIRQEFSEDMSIKRALSIAVDRRPDLRLEGLGHKVLQWYLCRMEGWFSADSDTISLRGWDQEELLPGGHGLMVRGYRPVINTLAKGLDIRLGHRVIKVVRRYNGVKVTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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