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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000416`

染色体: Chr02 坐标: 5301727-5303520 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000416`
名称	SmilChr02G000416
描述	uncharacterized SmilChr02G000416
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	5301727 - 5303520 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012801`
GeneID	`131012801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012801`
原始查询	`SmilChr02G000416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=31.6; qcov=0.393; evalue=2.87e-09; confidence=low
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=28.6; qcov=0.373; evalue=1.7e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796786.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796786.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796786.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796786.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:5301970`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B139,B17,B36,B61,B77,C50
`Chr2:5302096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,B98,C73
`Chr2:5302151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:5302199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:5302210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:5303161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B132,B17,B34
`Chr2:5303187`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B98
`Chr2:5303187`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B98
`Chr2:5303245`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A5,C13,C34,D1,D9
`Chr2:5303245`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A5,C13,C34,D1,D9
`Chr2:5303322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796786.1

394 aa

197

394

FBA_3

PF08268 FBA_3 19-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796786.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	19	194	6.4e-21	75.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940803.1
TATAAATTCCATGTGGGTTTCGAAAATAAAGCGCATTCCATGTCGGTTTCGGTATAAAGTTTGTTCAGATTTATAAAAACCCTAGCTTCTTCCCAAATTGATTTTCAGCACGCCTATTCAAATCAAAAGCCAATCCTATCGCGTCTTCTTTCCTCAAAGCTAAGAAATCGACAAAGCTTCCCCACCCAAAGATAGTTCGTCGGAGACGAGAGGTTATCATTAACCCCTTTTGCAGAATGAATGGTTTTTTTTTGAAACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012801
ATGAATGGTTTTTTTTTGAAACGCAAGTATGATGATGGTGGCGATAAAAATTATTTATCTTTATTTTCTGGGCAAGATTGGTCTAGGTGTGAAAATCATGAAAGTATAGTGCTTCCATTCTCTAAAAAATCTCGTATCCATGGTAGTAGTTGCGGTGGATTATTTTATTTTGACAATTTTAAAGGTAGGATTATAATTTGCAATCCAACCACCAAAACTTTCAAATCTCTTGATCCGCCCAAAATGCCAAACCCTCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796786.1
MNGFFLKRKYDDGGDKNYLSLFSGQDWSRCENHESIVLPFSKKSRIHGSSCGGLFYFDNFKGRIIICNPTTKTFKSLDPPKMPNPPNITMFSCSGLGYDHISDDYKVVRRFYHSYGTYLDTVYKAEVFSLKRGSWKEINSHVDGSILDTRVCTDGIYINGVCYWLAASWKVVSFDFTDERFSFFNLPVFSSFNSPMKNLYDYVKFRYDLIKVNDMVGVFRSQKPPPLGPGCFGFSTTFELFVRKEGSWVPWCNVHLCDIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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