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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000421`

染色体: Chr02 坐标: 5395162-5399566 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000421`
名称	SmilChr02G000421
描述	uncharacterized SmilChr02G000421
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	5395162 - 5399566 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012804`
GeneID	`131012804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012804`
原始查询	`SmilChr02G000421`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0100500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0100500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G39950` (AT2G39950) flocculation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818582] identity=61.4; qcov=0.257; evalue=2.04e-17; confidence=weak
Rice	`Os07g0100500` - identity=35.4; qcov=0.662; evalue=9.98e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796789.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796789.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796789.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057796790.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:5395860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:5395937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:5395948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr2:5395958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C50
`Chr2:5395960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:5395992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr2:5396089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B79,C57
`Chr2:5396148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:5396164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B72,C67
`Chr2:5396241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67
`Chr2:5396243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B44
`Chr2:5396294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940807.1
TCTCAGAATCAGTCGAGCTCTTTCTCAAAATCAGTCGAGAACTCTTGTTTTCTCCCTCAAACATCAGTCGCGGTCTCTCTCTCTCTAAATCAGTCGAGGTTGCAGCCGCCGCCTCTGCTCCGACCGGCGTCGGCTGCCGCCGATCCTAGGTCCGGCGTGGCCGCACCCGCCTCTCTCTCCTTATCTTCTCTCTTGCTGACAGTTCGTCCGAGGCGAGAAGGGCGAGCCCTAATTCCTCCCTGGCATTGCAATCGCCGCTG...

XM_057940806.1
TCTCAGAATCAGTCGAGCTCTTTCTCAAAATCAGTCGAGAACTCTTGTTTTCTCCCTCAAACATCAGTCGCGGTCTCTCTCTCTCTAAATCAGTCGAGGTTGCAGCCGCCGCCTCTGCTCCGACCGGCGTCGGCTGCCGCCGATCCTAGGTCCGGCGTGGCCGCACCCGCCTCTCTCTCCTTATCTTCTCTCTTGCTGACAGTTCGTCCGAGGCGAGAAGGGCGAGCCCTAATTCCTCCCTGGCATTGCAATCGCCGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012804
ATGGTTTTTTATTTTTGGTGCTCTGAGAAATCTCAATATTTAGGGAATGAAATGCTCAGGAAGATGATTGATTTGCTTATAAGAAAACCTTCACTGGCTGAATTAACTGGAATAAGTGATGGCCGCCTCAACTTCTTTGCAACTCAGCTCAGAGCTTATCTCCATGGATCAGTAGTGAGTAAAGCACAGTCTATTGGTGTTCTGCCGTCTAACGGTCCTTCAGATGATGATTCATTTGATTCTTCTGAGCTTCATTATCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796789.1
MVFYFWCSEKSQYLGNEMLRKMIDLLIRKPSLAELTGISDGRLNFFATQLRAYLHGSVVSKAQSIGVLPSNGPSDDDSFDSSELHYPQSSITCEKRSLFQQYGCRGLMTNLNHLDGHYPKSGSFEASLPKSLSFENVTARENLMQVGDGNASPNSLFLASTSDADLSNSIGFAKGKLPKANLVHSFSVLNVVDAFGKPLDVPLCGPKVQVHSSGPSHLSPQYCWCPPVASVLHYTLRNSQMSTESLHLPPLSSLLASKSS...

XP_057796790.1
MVFYFWCSEKSQYLGNEMLRKMIDLLIRKPSLAELTGISDGRLNFFATQLRAYLHGSVVSKAQSIGVLPSNGPSDDDSFDSSELHYPQSSITCEKRSLFQQYGCRGLMTNLNHLDGHYPKSGSFEASLPKSLSFENVTARENLMQVGDGNASPNSLFLASTSDADLSNSIGFAKGSFLWSISFVSSILLVSSRCFSAALHSQELPNVNRVSSFAATFFSTGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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