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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000437`

染色体: Chr02 坐标: 5699949-5701446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000437`
名称	SmilChr02G000437
描述	uncharacterized SmilChr02G000437
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	5699949 - 5701446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012816`
GeneID	`131012816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012816`
原始查询	`SmilChr02G000437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=52.8; qcov=0.281; evalue=2.22e-37; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=51.9; qcov=0.865; evalue=3.47e-147; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796795.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057796795.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057796795.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796795.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:5700054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,B72,C87
`Chr2:5700072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A1,A4,B102,B18,B22,B38,B4,B57,B78,C16,C18,C20,C24,C41,C51,C52,C56,C59,C72,C76,C81,D1,D10,D2
`Chr2:5700073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A1,B4,B78,C41,C72,C76,D1
`Chr2:5700078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C87
`Chr2:5700081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C18
`Chr2:5700087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B67
`Chr2:5700092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B92,C24,C34,C4
`Chr2:5700105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C47,C53,C76,D1,D2
`Chr2:5700106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B131,B56,B78
`Chr2:5700113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:5700116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B78
`Chr2:5700124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B90,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796795.1

452 aa

226

452

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 72-111 aa PF04827 Plant_tran 180-382 aa PF13359 DDE_Tnp_4 209-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796795.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	72	111	1.8e-21	76.3	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057796795.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	180	382	2.2e-107	358.0	Plant transposon protein
`XP_057796795.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	209	372	1.1e-10	42.1	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940812.1
TATACCTCCACCCTATTATTTTTCCATTTCTCATACAAATATGTCTGTGAATGAAAACTCTTCGGTTGATTCAGACTCAAGTTCTGATGTTTCCCATTCCAATGAACTTGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAACTTGATAGCATCATCCAAAATATGATCATAAACAATCATAATCTGATTGTAGGAAATCAAATTCCAACAGTCAACAGGAGATATTGTGATAGGGAACGCGAGTTTGGTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012816
ATGTCTGTGAATGAAAACTCTTCGGTTGATTCAGACTCAAGTTCTGATGTTTCCCATTCCAATGAACTTGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAACTTGATAGCATCATCCAAAATATGATCATAAACAATCATAATCTGATTGTAGGAAATCAAATTCCAACAGTCAACAGGAGATATTGTGATAGGGAACGCGAGTTTGGTGCAGAGCGTTTGATCAACGACTACTTCAGTGACAGCCCAACGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796795.1
MSVNENSSVDSDSSSDVSHSNELDEWEERVYQQNRQLDSIIQNMIINNHNLIVGNQIPTVNRRYCDREREFGAERLINDYFSDSPTYTPEIFRRRFRMQKSLFIRIVEAVTANDEFFQQRRDATGRVGLSSLQKCTGAMRVLAYGTSSDVVDEYLRMSSSSTRDALVHFVEGVISCFGGTYLRRPNEQDLARLLYVGEQRGFPGMIGSIDCMHWEWKNCPNAWAGQYTGRSGKPTIILEAVASYDLWIWHAFFGTPGSCN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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