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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000439`

染色体: Chr02 坐标: 5709996-5710865 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000439`
名称	SmilChr02G000439
描述	uncharacterized SmilChr02G000439
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	5709996 - 5710865 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007893`
GeneID	`131007893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007893`
原始查询	`SmilChr02G000439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=26.9; qcov=0.875; evalue=6.17e-16; confidence=low
Rice	`Os12g0169300` - identity=25.3; qcov=0.931; evalue=3.54e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790788.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790788.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790788.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790788.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:5710003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B110
`Chr2:5710004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B51
`Chr2:5710025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A24,B12,B128,B135,B73,B76,B90,B92,B93,C31,C45,C50,D1
`Chr2:5710035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B34,B68,D6
`Chr2:5710043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B56,C14,C18,C35
`Chr2:5710049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A5,B60,B88
`Chr2:5710051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:5710053`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B72,B88,C54,C67
`Chr2:5710053`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B72,B88,C54,C67
`Chr2:5710084`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B105,B40,B50,C18,C23,C29,C32,C42,D7
`Chr2:5710115`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A24,B126,B99,C1,C19,C36,C60,C65
`Chr2:5710116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B13,B18,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790788.1

289 aa

144

289

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 134-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790788.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	134	262	9.4e-08	33.8	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934805.1
ATGGGTGTTCAACAACGCCCAAACAAAAATCATAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAGGAAGATGTTGCTCTTATGTCATCTTGGATCTATGCTAGCGAAGATAACATTCGAGGAAAAAATCAAAGAGGGGAATCGCTTTGGGCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACCCAAGCAGAAAATCCAAATGAGCTCAACGAACGAAACATTGAATCGATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007893
ATGGGTGTTCAACAACGCCCAAACAAAAATCATAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAGGAAGATGTTGCTCTTATGTCATCTTGGATCTATGCTAGCGAAGATAACATTCGAGGAAAAAATCAAAGAGGGGAATCGCTTTGGGCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACCCAAGCAGAAAATCCAAATGAGCTCAACGAACGAAACATTGAATCGATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790788.1
MGVQQRPNKNHKGAKNVAWCVKEDVALMSSWIYASEDNIRGKNQRGESLWARVHKLYHNTQAENPNELNERNIESMKGRWKRLNENGNKWVAACREANARRRSGMSDNDVEKEAHSIYEAGGNKFLDLVVFNEVMSKHPKWNVHDTTHVFRRQSEDADDQESGGSSKRSKTSEDGGFSIPSNPETPTSEQSTATRPIGRDKAKRKGKGKVSQSESTHESAVAAELRAMRLTRDAEAELIKTRIELEREKLQRNAMKMKEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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