当前解析结果
SmilChr02G000445| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000445 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000445 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000445 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 5829772 - 5831662 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007897 |
|---|---|
| GeneID | 131007897 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007897 |
| 原始查询 | SmilChr02G000445 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007897 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790793.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057790793.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057790793.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790793.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790793.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:5829792 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B52,C80 |
Chr2:5829792 |
A |
AC |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B52,C80 |
Chr2:5829823 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C14,C25,C65,C78 |
Chr2:5829825 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,C78 |
Chr2:5829855 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B24,B25,B42,B43,B55,B88,B90 |
Chr2:5829874 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,C41,C78 |
Chr2:5829879 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr2:5829889 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:5829922 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr2:5829927 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B4,B74,C2,C39,C68 |
Chr2:5829936 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 123 | A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A21,A23,A3,A6,A8,B10,B100,B101,B107,B108,B111,B112,B115,B119,B12,B122,B125,B132,B133,B136,B137,B14,B140,B15,B16,B18,B2,B22,B27,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B4,B41,B42,B46,B5,B50,B52,B53,B56,B57,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B8,B86,B89,B91,B93,B96,B97,B98,C11,C14,C16,C18,C19,C2,C21,C23,C27,C29,C3,C30,C32,C33,C36,C37,C38,C39,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C59,C61,C68,C69,C70,C71,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C86,D2,D4,D6,D8 |
Chr2:5829940 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B84,C29,C30,C33,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。