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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000464`

染色体: Chr02 坐标: 6218246-6218740 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000464`
名称	SmilChr02G000464
描述	uncharacterized SmilChr02G000464
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6218246 - 6218740 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007902`
GeneID	`131007902`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007902`
原始查询	`SmilChr02G000464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0458700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0458700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G51080` (AT5G51080) RNase H family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835181] identity=31.9; qcov=0.555; evalue=1.77e-06; confidence=low
Rice	`Os10g0458700` - identity=27.8; qcov=0.549; evalue=1.79e-07; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00075 (RNase_H); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007902

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790797.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790797.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790797.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790797.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790797.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6218261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr2:6218275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C33,C78
`Chr2:6218319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr2:6218321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:6218325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:6218347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr2:6218361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr2:6218363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:6218370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C58
`Chr2:6218455`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A1,C42,D8
`Chr2:6218455`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A1,C42,D8
`Chr2:6218458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C42,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790797.1

164 aa

164

RNase_H

RVT_3

PF00075 RNase_H 38-130 aa PF13456 RVT_3 45-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790797.1`	Pfam	`PF00075`	RNase_H	Domain	38	130	3.3e-09	37.8	RNase H
`XP_057790797.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	45	158	3.5e-13	50.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934814.1
ATGACCTTTAGTGGCGAAAAAACTTTGAAGCATTTGACCCGCTTGAGTACTAGTGTCAAATCCATAAGAGGAAGACTTGCTACTCCTAAGCAATTGTTAGAGTGGGTGCCCTTCTCGGACGGTTCAATTACTAAGGATGGTGGTGGAGTGGGAATTTACATAGCTTCCCTTGCCGAAGATGTATTACAATTTGCAGTCAAAATGGAGTATAAGATATCTAATAACGATGCAGAGTATGAGGCAACCATCAAAGCTTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007902
ATGACCTTTAGTGGCGAAAAAACTTTGAAGCATTTGACCCGCTTGAGTACTAGTGTCAAATCCATAAGAGGAAGACTTGCTACTCCTAAGCAATTGTTAGAGTGGGTGCCCTTCTCGGACGGTTCAATTACTAAGGATGGTGGTGGAGTGGGAATTTACATAGCTTCCCTTGCCGAAGATGTATTACAATTTGCAGTCAAAATGGAGTATAAGATATCTAATAACGATGCAGAGTATGAGGCAACCATCAAAGCTTTACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790797.1
MTFSGEKTLKHLTRLSTSVKSIRGRLATPKQLLEWVPFSDGSITKDGGGVGIYIASLAEDVLQFAVKMEYKISNNDAEYEATIKALQMLVHLNVEKVILYTDSQLVAQQFMGHYEVREERIEVYSQKLKTLSKKFEEFVLQQVPKFENGKVDMLARMASALDQI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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