当前解析结果
SmilChr02G000469| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000469 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000469 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 79B3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 6341401 - 6343537 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012843 |
|---|---|
| GeneID | 131012843 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012843 |
| 原始查询 | SmilChr02G000469 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 79B3-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 79B3-like |
| Arabidopsis | AT4G27570 (AT4G27570)UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828866] identity=54.6; qcov=0.996; evalue=1.46e-178; confidence=high |
| Rice | Os11g0457300 (UGT)- identity=36.3; qcov=1.01; evalue=2.83e-94; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012843 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057796814.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057796814.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057796814.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796814.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796814.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:6341688 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr2:6341734 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,B93 |
Chr2:6341763 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B110 |
Chr2:6341763 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr2:6341827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
Chr2:6342181 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr2:6342197 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr2:6342335 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr2:6342436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,D11 |
Chr2:6342481 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B52,C29,C35,C38,C7 |
Chr2:6342484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr2:6342502 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B22,B93 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057796814.1PF00201
UDPGT 334-419 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057796814.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 334 | 419 | 1.4e-11 | 44.6 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。