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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000494`

染色体: Chr02 坐标: 6813684-6815029 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000494`
名称	SmilChr02G000494
描述	uncharacterized SmilChr02G000494
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6813684 - 6815029 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012862`
GeneID	`131012862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012862`
原始查询	`SmilChr02G000494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0225200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0225200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=30.6; qcov=0.928; evalue=1.4e-22; confidence=low
Rice	`Os06g0225200` - identity=34.8; qcov=0.964; evalue=4.21e-27; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796835.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796835.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796835.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796835.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6814384`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A1,A10,A13,A25,A6,B11,B139,B31,B35,B42,B43,B48,B5,B61,B64,B65,C3,C31,C34,C35,C37,C40,C43,C45,C47,C63
`Chr2:6814385`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	26	A1,A10,A13,A25,A6,B11,B139,B31,B35,B42,B43,B48,B5,B61,B64,B65,C3,C31,C34,C35,C37,C40,C43,C45,C47,C63
`Chr2:6814419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C58,C9
`Chr2:6814476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr2:6814483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C79
`Chr2:6814575`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A21,B113,B115,B28,B30,B36,B41,B51,C3,C86
`Chr2:6814584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B91
`Chr2:6814706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:6814712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C64,C79
`Chr2:6814759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B91
`Chr2:6814916`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr2:6814916`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796835.1

194 aa

194

mTERF

PF02536 mTERF 3-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796835.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	3	176	4.9e-24	85.5	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940852.1
TGTATATAATTCACATTTATGTATGCGCGACACACACACACTATCTCTTCTTTTTGGGTTTAAGGCTCTGGAGCAGAGCTGCGGCTCATAAACCGTAAGTCTTCCATTAATGGAGATTTTGGAGACAAATTCATAGCTAAAGCTTCAACCTTCCATAACATGGCGGCTCTAATTCTACGCCGCACTCTAATCTCCTTCTTCTCCGCCACCAATTCCTCACTTCGTCCCCAAATCTCACTTCTCCGTCTCCCTGTATTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012862
ATGGAGAGCACTTTTGTCCCAAATGTGGAATTACTGAAGAGCTGCGGCGTTCCAATTGAGCAGATCACGAGGGCAATAATCCAAATGCCTCGATTCTTCCTGCTCAAACCGGTAAAGATGAGGAAATTCATCGAGAAAGCGGAGGAATTAGGGTCTGATCGCGGATCGCGGAGCTTCATCCGCGCCGTTAAGGTTGTGAGTTCGATGACGAGCGAGACTTTGGGAGTGAAGATGGAGGCGTTACGCGAGCTCGGATTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796835.1
MESTFVPNVELLKSCGVPIEQITRAIIQMPRFFLLKPVKMRKFIEKAEELGSDRGSRSFIRAVKVVSSMTSETLGVKMEALRELGFSDSDIARAFRNSPQVLATSPEKMRRVAEVVVGSGRYDRMSIVERPCVFMYSVEKRIWPRIKVLRVLEEKKKMIGGWPSLATMLTLTDAMFFHKFVSPNLEQDDCRAVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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