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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000496`

染色体: Chr02 坐标: 6833150-6833923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000496`
名称	SmilChr02G000496
描述	protein TIME FOR COFFEE-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6833150 - 6833923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012864`
GeneID	`131012864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012864`
原始查询	`SmilChr02G000496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIME FOR COFFEE-like
产物	protein TIME FOR COFFEE-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0042752 (regulation of circadian rhythm)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796837.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796837.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796837.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796837.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6833397`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A9,B127,B79,B98,C27,C33,C54
`Chr2:6833401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:6833448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,D6
`Chr2:6833452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:6833454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:6833516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B65
`Chr2:6833518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:6833529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A16,A3,A4,B119,B128,B130,B15,B27,B45,B73,C1,C23,C31,C42,C57,C67,C84,C87
`Chr2:6833539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B13,C27
`Chr2:6833582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C84
`Chr2:6833589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:6833590`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A7,B111,B80,C14,C24,D4,D6

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940854.1
AGCCCATTTCCACTCTCAGAAAACCCTCTCGACTGTGTTCTCCCACCGCCGCGCCCTCCGGCGAGACAAGTCGTCGGCGTCGGGGCTGGGGCGACGCCTGTGCCGCCGGCGGCTCCGATGTCTCCGTCTTCTTCCAACGTTTCCATGAGGAAGAAGCTTAAGCAGACTGTGAACAACTCAGGGCTAAAGCTGAAGCCGCCGAAAGTCGCGGCGGCGGCTGCGTCGAAGCCGAGCTCATCGAATCCGGAGGAGTTGGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012864
ATGTCTCCGTCTTCTTCCAACGTTTCCATGAGGAAGAAGCTTAAGCAGACTGTGAACAACTCAGGGCTAAAGCTGAAGCCGCCGAAAGTCGCGGCGGCGGCTGCGTCGAAGCCGAGCTCATCGAATCCGGAGGAGTTGGAGATTGAAATCGCGGAGGTGTTGTACGGCTTGATGACTCAGTCGCAAGCCCCTTCATCGAAGAAGGAGGAGTCGAGAGAAATCAACAGATTGGGCAGCGATGCGAAATCGCATAATTCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796837.1
MSPSSSNVSMRKKLKQTVNNSGLKLKPPKVAAAAASKPSSSNPEELEIEIAEVLYGLMTQSQAPSSKKEESREINRLGSDAKSHNSSPISNSPSANNPNLGSNSGPLSAVAPKRKRPRQIPENSSYGARSSPVPAKLEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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