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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000499`

染色体: Chr02 坐标: 6874112-6877974 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000499`
名称	SmilChr02G000499
描述	riboflavin synthase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6874112 - 6877974 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012867`
GeneID	`131012867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012867`
原始查询	`SmilChr02G000499`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	riboflavin synthase-like
产物	riboflavin synthase-like
Arabidopsis	`AT2G20690` (AT2G20690) lumazine-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816597] identity=67.4; qcov=0.772; evalue=2.3e-101; confidence=high
Rice	`Os12g0541000` - identity=50.4; qcov=0.986; evalue=1.41e-83; confidence=high
GO	GO:0004746 (riboflavin synthase activity); GO:0009231 (riboflavin biosynthetic process)
KEGG	smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00677 (Lum_binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796838.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057796838.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796838.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796838.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6874282`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr2:6874282`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr2:6874467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:6874741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B35,C10,C80,D7
`Chr2:6874788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr2:6874793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B48,C10,C42,D5
`Chr2:6874883`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B111
`Chr2:6874883`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B111
`Chr2:6874898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,D5
`Chr2:6874930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796838.1

290 aa

145

290

Lum_binding

PF00677 Lum_binding 76-160 aa PF00677 Lum_binding 183-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796838.1`	Pfam	`PF00677`	Lum_binding	Domain	76	160	1.2e-46	157.3	Lumazine binding domain
`XP_057796838.1`	Pfam	`PF00677`	Lum_binding	Domain	183	269	1.2e-46	157.3	Lumazine binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097493.1
TTTAAGTAGCATCTTTTTTATTGCTGCCGCCAATTTGTAAAAAAGAATGGCTCTGTCTTGCCCACAAACCCTCCTCCACGGCCACCGCCGGAATCCCTCGCCAGTGGCGAGAACACTCTTTATTTCCGACATTTCCGCCGCTGCACCGCCGCGGCAACCTCAACTCCACTCCAAGCTAGTTCTAAAACAGCCCCCACTTTCACCCATCTTTATTAAACCCTCCAAACCCCACCACTCCAAATCCGTCAACACCAACGTGA...

XM_057940855.1
TAAGAGTTTAAGTAGCATCTTTTTTATTGCTGCCGCCAATTTGTAAAAAAGAATGGCTCTGTCTTGCCCACAAACCCTCCTCCACGGCCACCGCCGGAATCCCTCGCCAGTGGCGAGAACACTCTTTATTTCCGACATTTCCGCCGCTGCACCGCCGCGGCAACCTCAACTCCACTCCAAGCTAGTTCTAAAACAGCCCCCACTTTCACCCATCTTTATTAAACCCTCCAAACCCCACCACTCCAAATCCGTCAACACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012867
ATGGCTCTGTCTTGCCCACAAACCCTCCTCCACGGCCACCGCCGGAATCCCTCGCCAGTGGCGAGAACACTCTTTATTTCCGACATTTCCGCCGCTGCACCGCCGCGGCAACCTCAACTCCACTCCAAGCTAGTTCTAAAACAGCCCCCACTTTCACCCATCTTTATTAAACCCTCCAAACCCCACCACTCCAAATCCGTCAACACCAACGTGAAATCCCTTTTCACCGGAATCGTGGAAGAAATGGGAACAATCAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796838.1
MALSCPQTLLHGHRRNPSPVARTLFISDISAAAPPRQPQLHSKLVLKQPPLSPIFIKPSKPHHSKSVNTNVKSLFTGIVEEMGTIKHLGFDQPDSFTMKIQAKTVLEGVHLGDSIAVNGTCLTVTEYDTVLGEFSVGLAPETLRKTSLGELESGSLVNLESGSLVNLERALSPSTRMGGHFVQGHVDGTGEIAELRAEGDSLWVKVKVGREILRYIVPKGFIAVDGTSLTVVDVFDDEGCFNFMLVAYTQQKVVIALKKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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