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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000505`

染色体: Chr02 坐标: 6957928-6960247 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000505`
名称	SmilChr02G000505
描述	GPI-anchored protein LLG3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6957928 - 6960247 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012869`
GeneID	`131012869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012869`
原始查询	`SmilChr02G000505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPI-anchored protein LLG3-like
产物	GPI-anchored protein LLG3-like
Arabidopsis	`AT4G28280` (LLG3) LORELEI-LIKE-GPI ANCHORED PROTEIN 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828943] identity=50; qcov=0.882; evalue=3.05e-47; confidence=medium
Rice	`Os02g0721700` - identity=47.7; qcov=0.938; evalue=8.12e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26578 (LLG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796842.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057796842.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796842.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796842.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6958015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B75
`Chr2:6958036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C31
`Chr2:6958154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C37
`Chr2:6958175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr2:6958208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B25,B54
`Chr2:6960031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B121,B3,B83,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796842.1

161 aa

161

LLG1

PF26578 LLG1 49-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796842.1`	Pfam	`PF26578`	LLG1	Domain	49	125	3.9e-35	120.3	LLG1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940859.1
TCTTCTCCCGATTTCTTCTCCTGCATAACCTCTCCTGCAAAATCACCAACTCAAAGAAACCCAAAATTAGAAAAAAGAAAAATAACGAGAAAAAGAAAAAAAAAACAAAATATTTGATTAGACAAAGGAAATAGGAAATAGCAATCCACAGAAAAATCGGTTGAAAATCCCATCTGCAGAAGGAAGAAGGCATCAATGGATTCCAACAAATCCTTGCTGCATTTGTTTCTTTTCTTCCTTGTTGTTGGCATTGCATCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012869
ATGGATTCCAACAAATCCTTGCTGCATTTGTTTCTTTTCTTCCTTGTTGTTGGCATTGCATCTTCTTCCCACATTTCAAATGGGATTTTTGAACCGCACAGATCAATTGGTCGTTCGCTTCTGCAGCAGAAATCAAGTTGCGCCGTGGATTTCGAGAACATGAACTACACAGTGATCACAAGCCAATGCAAGGGGCCAAATTACTCAGCAGGTAGATGCTGCCCTCCATTGAAGCAGCTGCTCTGCCCTGTGAAAGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796842.1
MDSNKSLLHLFLFFLVVGIASSSHISNGIFEPHRSIGRSLLQQKSSCAVDFENMNYTVITSQCKGPNYSAGRCCPPLKQLLCPVKDQINDLKSDCADVFFSYVNLYGKYPPGLFASLCKEGEAGLDCKGVNVSKNGAACAACSSYLVMIIAALAFMLFCIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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