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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000506`

染色体: Chr02 坐标: 6958277-6966651 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000506`
名称	SmilChr02G000506
描述	uncharacterized SmilChr02G000506
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6958277 - 6966651 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012868`
GeneID	`131012868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012868`
原始查询	`SmilChr02G000506`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839052]; symbol=AT1G03687; hit=AT1G03687; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839052]; symbol=AT1G03687; hit=AT1G03687; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G03687` (AT1G03687) DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839052] identity=63.2; qcov=0.85; evalue=2.27e-125; confidence=high
Rice	`Os06g0342750` - identity=55; qcov=0.76; evalue=2.69e-96; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03942 (DTW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796839.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796841.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796839.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796839.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6962281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B74,C17,C27,C86
`Chr2:6962318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C2
`Chr2:6962373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B122,B7,B93,C61
`Chr2:6963639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:6964233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:6964447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B72
`Chr2:6964473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:6964734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C2
`Chr2:6964777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,B90,B92,C12
`Chr2:6964783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C74
`Chr2:6966300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:6966465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B74,C17,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796839.1

385 aa

192

385

DTW

PF03942 DTW 146-361 aa

XP_057796840.1

384 aa

192

384

DTW

PF03942 DTW 146-361 aa

XP_057796841.1

313 aa

156

313

DTW

PF03942 DTW 146-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796839.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	146	361	2.2e-39	136.0	DTW domain
`XP_057796840.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	146	361	2.2e-39	136.0	DTW domain
`XP_057796841.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	146	312	1e-30	107.7	DTW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097494.1
GCAAAAAATTTCATAATGTTTAACCCTATATAACATAAAATATTTTACTAATTTCCCAATGCTCATTTCTAATTCTACTCGTCGAACCTTGTTCAGCTCAAAGACTACATTTTTATTCGATTCCCACCGAAACTTGCTCAATTACTTGATACCCTTTACCGCAAAACCCCAATCTTCGATGTCAGCGGATACCCTCACACCAGCAGACATTGATGATGCAGCAACCATTAGCCTCGAAGAATGGCAGGGCTGGGGCACCG...

XM_057940857.1
GCAAAAAATTTCATAATGTTTAACCCTATATAACATAAAATATTTTACTAATTTCCCAATGCTCATTTCTAATTCTACTCGTCGAACCTTGTTCAGCTCAAAGACTACATTTTTATTCGATTCCCACCGAAACTTGCTCAATTACTTGATACCCTTTACCGCAAAACCCCAATCTTCGATGTCAGCGGATACCCTCACACCAGCAGACATTGATGATGCAGCAACCATTAGCCTCGAAGAATGGCAGGGCTGGGGCACCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012868
ATGCTCATTTCTAATTCTACTCGTCGAACCTTGTTCAGCTCAAAGACTACATTTTTATTCGATTCCCACCGAAACTTGCTCAATTACTTGATACCCTTTACCGCAAAACCCCAATCTTCGATGTCAGCGGATACCCTCACACCAGCAGACATTGATGATGCAGCAACCATTAGCCTCGAAGAATGGCAGGGCTGGGGCACCGTGTCGCCGCTGCCGGCGATGGTGGATCAAGTTATTCATGATATGAAGCTTCTGGAGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796839.1
MLISNSTRRTLFSSKTTFLFDSHRNLLNYLIPFTAKPQSSMSADTLTPADIDDAATISLEEWQGWGTVSPLPAMVDQVIHDMKLLEKDIDAPMTFGGNRGALTGCFKVAEDKKHRAKYASLDTPEEKLQFFSARQIACRLLGSRGYLCQKCWLPQEDCVCSKIKACSMWHRLHIWLYMHPKDFLRQNNTGKLLWQVFGVQAASLCVFGIAEHEEMMWNELNRAGRNKVWCLYPNKNAVTESVKDIVGCSTNPESQAEPAN...

XP_057796840.1
MLISNSTRRTLFSSKTTFLFDSHRNLLNYLIPFTAKPQSSMSADTLTPADIDDAATISLEEWQGWGTVSPLPAMVDQVIHDMKLLEKDIDAPMTFGGNRGALTGCFKVAEDKKHRAKYASLDTPEEKLQFFSARQIACRLLGSRGYLCQKCWLPQEDCVCSKIKACSMWHRLHIWLYMHPKDFLRQNNTGKLLWQVFGVQAASLCVFGIAEHEEMMWNELNRAGRNKVWCLYPNKNAVTESVKDIVGCSTNPESQAEPAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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