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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000517`

染色体: Chr02 坐标: 7143063-7145270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000517`
名称	SmilChr02G000517
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7143063 - 7145270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012873`
GeneID	`131012873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012873`
原始查询	`SmilChr02G000517`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47580` (AT3G47580) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823912] identity=54.4; qcov=1.03; evalue=4.22e-42; confidence=medium
Rice	`Os11g0692500` - identity=52.2; qcov=1; evalue=3.24e-45; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057796844.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796844.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057796844.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796844.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7143545`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B105,B44,B80,C19,C36,C85
`Chr2:7143586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:7143619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B67,C59,C81
`Chr2:7143656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C1
`Chr2:7143679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:7143866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B73,B81
`Chr2:7143910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796844.1

134 aa

134

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 3-106 aa PF00069 Pkinase 5-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796844.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	3	106	6.9e-19	68.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796844.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	5	106	7.6e-22	78.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940861.1
TGACATTGGTTTTCCAAGAAAATGAGTTATCTGGTAATATTCCACTAACTATAAGCCATTTGCATGAACTGCAAGGATTATATCTGTCTGATAACATGTTGGGAGGCTCAATACCACATGCTATATGTGATCTATTCAACCTCAATACTTTATATTTAAGCCACAATCAATTTTCTGGACCAATTCCTAAATGTCTAGGAAATGTCTCTTCTTTAAGAAATATTTTTCTACACTCCAACATGTTGAATTCAAGCATACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012873
ATGGAAAGATTGAATATAATGATTGATGTTGCATCTTCTTTGGAGTATCTTCACCATGGTTATTCAACGCCCATTGTCCACAGTGACTTGAAGCCTAGTAATGTGTTGTTAGATGAAGACATGGTTGCCCATGTAAGCGATTTTGGGATAGCAAAGTTGTTATGTGATGGAGATAGCTTTGTGTTAACCAACACGCTACCAACATTGGGTTACATCGCTCCAGAGTATGGTTTGGAAGGGCTAGTTTCGATAAAATGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796844.1
MERLNIMIDVASSLEYLHHGYSTPIVHSDLKPSNVLLDEDMVAHVSDFGIAKLLCDGDSFVLTNTLPTLGYIAPEYGLEGLVSIKCDVYSYGVMLIETFTRKRPSDDMFCGDLSLKSWVELSLPEMPDKVIDAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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