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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000523`

染色体: Chr02 坐标: 7180175-7183488 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000523`
名称	SmilChr02G000523
描述	receptor-like protein 43
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7180175 - 7183488 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012878`
GeneID	`131012878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012878`
原始查询	`SmilChr02G000523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 43
产物	receptor-like protein 43
Arabidopsis	`AT2G25440` (RLP20) receptor like protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817082] identity=38.5; qcov=1.01; evalue=1.69e-101; confidence=medium
Rice	`Os01g0161000` - identity=37.2; qcov=0.998; evalue=3.7e-91; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796850.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796850.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796850.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796850.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7180270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:7180312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:7180852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B62,B82,C63
`Chr2:7180898`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,B134,B53,B78,C2,C26,C32,C66,C68
`Chr2:7181454`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr2:7181454`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr2:7181500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr2:7182018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B16,B86,C78
`Chr2:7182026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B17,B84,B85
`Chr2:7182030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr2:7182039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B2,B53,C16
`Chr2:7182044`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B120,B123,B131,B17,B66,B84,B85,C23,C45,C63,C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796850.1

509 aa

254

509

LRR_1

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF00560 LRR_1 3-24 aa PF00560 LRR_1 51-73 aa PF23598 LRR_14 69-252 aa PF00560 LRR_1 75-97 aa PF00560 LRR_1 99-120 aa PF00560 LRR_1 122-144 aa PF13855 LRR_8 122-181 aa PF00560 LRR_1 170-192 aa PF00560 LRR_1 245-262 aa PF00560 LRR_1 310-330 aa PF13855 LRR_8 310-367 aa PF00560 LRR_1 333-354 aa PF00560 LRR_1 357-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	3	24	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	51	73	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	69	252	6.8e-24	85.0	Leucine-rich repeat region
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	75	97	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	99	120	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	122	144	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	122	181	1.5e-32	111.9	Leucine rich repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	170	192	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	245	262	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	310	330	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	310	367	1.5e-32	111.9	Leucine rich repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	333	354	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057796850.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	357	378	1.5e-39	126.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940867.1
ATTCCACAAGAGATTCATCATCTTCATAATTTACGAGAGTTGGACTTCAGTTCGAACAAGTTGTCAGGCACTTTGCCACCAAGCATTTTCAACATGTCTTCCTTGAAAATGATTGACTTATCAAGTAACACACTTAGCGGAGCATTGCCTTCAGAAATTGAGTACATGAATGAACTAGATATTTTGGAACTTGACAACAATGCTTTGATCGGTCCAATACCATCTACTGTTGGAAACCTATCAAGTTTGTACCACTTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012878
ATGTCTTCCTTGAAAATGATTGACTTATCAAGTAACACACTTAGCGGAGCATTGCCTTCAGAAATTGAGTACATGAATGAACTAGATATTTTGGAACTTGACAACAATGCTTTGATCGGTCCAATACCATCTACTGTTGGAAACCTATCAAGTTTGTACCACTTAAATCTTGGTTCCAACAAATTTAATGGTCCAATACCATCTACCATTGGAAACCTATCAAATTTGGGCCACTTGTATCTCGATTCAAACAAATTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796850.1
MSSLKMIDLSSNTLSGALPSEIEYMNELDILELDNNALIGPIPSTVGNLSSLYHLNLGSNKFNGPIPSTIGNLSNLGHLYLDSNKLNGQIPSTIGNLPLDILHLSSNKLIGELPSSICNLTSLDTLLLSNNTLEGIIPQCFGNLSSLIIFHLNKNQFRGHIPSTFSKGCSLVSINLNGNELQGQLPKSLINCQSLQGLDIGNNRIQDEFPFWMDYLPWLRVLVLRSNKFDGNMSLPSQTKIPFPNLQVLDISQNRFVGSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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