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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000535`

染色体: Chr02 坐标: 7374158-7375596 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000535`
名称	SmilChr02G000535
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7374158 - 7375596 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007928`
GeneID	`131007928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007928`
原始查询	`SmilChr02G000535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=40.4; qcov=1.04; evalue=1.7e-91; confidence=medium
Rice	`Os01g0694000` - identity=42.9; qcov=1.02; evalue=1.76e-117; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790822.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790822.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790822.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790822.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7374179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,C40,C42,C61
`Chr2:7374206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:7374216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B66,C28
`Chr2:7374217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B25,B54
`Chr2:7374271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:7374321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:7374325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:7374370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B137,C37,D3
`Chr2:7374415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,D11
`Chr2:7374448`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr2:7374448`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr2:7374502`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,B11,B130,B133,B137,B72,B88,C14,C51,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790822.1

421 aa

210

421

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 6-27 aa PF00069 Pkinase 149-417 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 152-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790822.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	6	27	6.2e-06	26.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057790822.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	149	417	1.5e-40	140.0	Protein kinase domain
`XP_057790822.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	152	421	1.5e-40	139.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934839.1
ATGGGAGGTCTAGTCAGTTTGGTAACTCTTGACTTATCCTACAACAACCTCTCTGGTTCGATCCCAAAGTCTTTAGAAGCACTTCAACACCTCGACTACTTTAATGTTTCTTTCAATAGTTTAATTGGAGAAATTCCTAATGGCGGTTCTTTTAGAAATTTCACTATGGACTCTTTTAAGGGTAATGAGGCATTGTGTGGAATCTCGAAGGTCCATGTCCAGATTTGCTCTTCAGTTTCTAATCACAAATCAAAGAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007928
ATGGGAGGTCTAGTCAGTTTGGTAACTCTTGACTTATCCTACAACAACCTCTCTGGTTCGATCCCAAAGTCTTTAGAAGCACTTCAACACCTCGACTACTTTAATGTTTCTTTCAATAGTTTAATTGGAGAAATTCCTAATGGCGGTTCTTTTAGAAATTTCACTATGGACTCTTTTAAGGGTAATGAGGCATTGTGTGGAATCTCGAAGGTCCATGTCCAGATTTGCTCTTCAGTTTCTAATCACAAATCAAAGAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790822.1
MGGLVSLVTLDLSYNNLSGSIPKSLEALQHLDYFNVSFNSLIGEIPNGGSFRNFTMDSFKGNEALCGISKVHVQICSSVSNHKSKRKNVERASFIIFGVVAITLLVCLAFMVVRYKRKEKTTREVDELISIVPERISYYELVQATEQFNEINLLGTGSSCSVYKGILNNGRDIAVKVFNMQLKGISRIFDVECEILRSIRHRNLTSVISSCSNEEFKALVLEYMPKGNLEKWLYSHNYCLNLMERLNIMIDVASALEYLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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