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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000543`

染色体: Chr02 坐标: 7493156-7496232 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000543`
名称	SmilChr02G000543
描述	CLIP-associated protein-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7493156 - 7496232 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007930`
GeneID	`131007930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007930`
原始查询	`SmilChr02G000543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CLIP-associated protein-like
产物	CLIP-associated protein-like
Arabidopsis	`AT2G20190` (CLASP) CLIP-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816539] identity=62.9; qcov=0.556; evalue=2.07e-21; confidence=medium
Rice	`Os02g0617300` - identity=58.6; qcov=0.556; evalue=3.77e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057790825.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790825.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790825.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790825.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7493554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:7494589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:7494591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B20
`Chr2:7494595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B82,C84
`Chr2:7494609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C31,D7
`Chr2:7494617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:7494633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:7494638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:7494639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C37,D3
`Chr2:7494662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A16,A18,A24,A5,B10,B107,B111,B112,B115,B135,B138,B18,B20,B23,B3,B36,B42,B52,B56,B58,B61,B67,B73,B74,B77,B83,B87,B89,B96,C20,C24,C27,C29,C32,C42,C46,C50,C52,C54,C68,C79,C82,D2
`Chr2:7494673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B73,B81,C58,C60
`Chr2:7494689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B82

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934842.1
ATGACGGCGTGCCTTGACTGTGTTAGTGAAGTAGTATATATAGGTTATGGGCCTGCAGGGAAGCGATTAGGGTTAGGGCTTTTTGGAATTTTTGGTTCATATGAATTTTACCCATTACACCTTCCACAGCAGACGCCGCCCCAAACTCCTCCCATAGCAGACGCCGTACCAAACACCTCCGTCCCCTTATTCCGGCAGGTTTCTTCACCAACAATCATCGTTGACAGGGTAGGATCTTACACTTGGATGCACAGAAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007930
ATGACGGCGTGCCTTGACTGTGTTAGTGAAGTAGTATATATAGGTTATGGGCCTGCAGGGAAGCGATTAGGGTTAGGGCTTTTTGGAATTTTTGGTTCATATGAATTTTACCCATTACACCTTCCACAGCAGACGCCGCCCCAAACTCCTCCCATAGCAGACGCCGTACCAAACACCTCCGTCCCCTTATTCCGGCAGGTTTCTTCACCAACAATCATCGTTGACAGGGTAGGATCTTACACTTGGATGCACAGAAGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790825.1
MTACLDCVSEVVYIGYGPAGKRLGLGLFGIFGSYEFYPLHLPQQTPPQTPPIADAVPNTSVPLFRQVSSPTIIVDRVGSYTWMHRSWRIQEEFARTAIGLFAATELPLQPAILPPDLLTIGCHHGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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