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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000564`

染色体: Chr02 坐标: 7961432-7967838 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000564`
名称	SmilChr02G000564
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7961432 - 7967838 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012905`
GeneID	`131012905`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012905`
原始查询	`SmilChr02G000564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
Arabidopsis	`AT4G27290` (AT4G27290) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828837] identity=40.5; qcov=1.08; evalue=1.42e-177; confidence=medium
Rice	`Os04g0631800` (OsRLCK162) - identity=41.4; qcov=1.05; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012905

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796863.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796863.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796863.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796863.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7961780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:7961829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:7961838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:7961842`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B17,B21,B8,C33,C43,C71
`Chr2:7961999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:7962006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:7965136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C31
`Chr2:7965151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:7965187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:7965377`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B14,B49,B68,C87,D5
`Chr2:7965377`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B14,B49,B68,C87,D5
`Chr2:7965384`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B124,B15,B22,C25,C45,C83,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796863.1

791 aa

396

791

B_lectin

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF01453 B_lectin 73-163 aa PF08276 PAN_2 313-374 aa PF00069 Pkinase 482-681 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 483-742 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796863.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	73	163	7.2e-18	65.7	D-mannose binding lectin
`XP_057796863.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	313	374	1.4e-10	41.8	PAN-like domain
`XP_057796863.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	482	681	3.2e-46	158.6	Protein kinase domain
`XP_057796863.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	483	742	4.7e-49	167.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940880.1
TAAAAAAAAATCCAATGGGTCCGTTCCCTCTATCTCTGAATAAGTCTCAACCTTTGGACCAAACGTGATGAGTTGAAAGCGAAAGAGGAATCTGCATGAATTTATTGAACTCTTCTAGATTGAGATATTTCGTGCACCCGTAAATAGCAGAGCAGGCCCTATATTTCCACAACAATAATTTTTTTTTGAAATTATTTCCACAACAATAATTAGAGTTGAAATATTCAACAAATGCCGTAGACGTATATTAAACCAGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012905
ATGACATTCATGTGTTTATCAATCTTGGTTTTTGCTCTGCCCATATTCTTGTCCAGTTTGGTTTGCAATGGATCAGACACCTTATTACTTGGCCAATCTCTCCTGCCAAACCAGACCTTAGTTTCGAAAGGGGGCAAATTTGAGTTGGGATACTTTTCTCCACCAAATTCCACCAATTTTTACATTGGCATATGGTACAAAAGCATACCCCTTCAGACCGTAGTTTGGGTGTTTAATAGGTACACACCTATCCTTAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796863.1
MTFMCLSILVFALPIFLSSLVCNGSDTLLLGQSLLPNQTLVSKGGKFELGYFSPPNSTNFYIGIWYKSIPLQTVVWVFNRYTPILNNSQLKLLYYDKYSSLCLLIAGIDDGEICFGTSSNIREALILDTGNFVMRNASGGILWQSFDEPTDTWLPGMKLTDSDSLYSWRNPNSLYSWRNPNDPSLGNYSLVSDKRQLFIRYNDNLSLWASGNHSNFSSSYNVALESSGTDEHFMYYKNYSDSLVSRIVIDYLGRLTRYGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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