当前解析结果
SmilChr02G000574| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000574 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000574 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000574 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 8131236 - 8133907 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012912 |
|---|---|
| GeneID | 131012912 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012912 |
| 原始查询 | SmilChr02G000574 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012912 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057796868.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057796868.1 |
| 3 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 0.20000 | XP_057796868.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057796868.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796868.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:8133108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B33,B76,D6 |
Chr2:8133109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C27,C32,C50,C68,D10 |
Chr2:8133125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B138 |
Chr2:8133128 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 40 | A1,A13,A15,A23,B104,B112,B125,B126,B132,B137,B138,B18,B20,B23,B24,B31,B32,B39,B42,B46,B5,B50,B7,B77,B86,B93,B95,C3,C31,C32,C54,C71,C73,C74,C78,C8,C86,D3,D7,D8 |
Chr2:8133134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C60 |
Chr2:8133137 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,C13,D10 |
Chr2:8133150 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,B57,C56 |
Chr2:8133161 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 67 | A1,A10,A13,A18,A23,B104,B112,B115,B117,B125,B126,B132,B137,B138,B17,B18,B21,B23,B24,B31,B32,B34,B38,B39,B40,B42,B46,B47,B49,B5,B50,B59,B62,B68,B7,B71,B77,B81,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B93,B95,B99,C1,C14,C27,C3,C31,C32,C53,C54,C55,C56,C68,C71,C73,C74,C78,C8,C86,D3,D7,D8 |
Chr2:8133170 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 67 | A1,A13,A18,A23,A8,B104,B115,B117,B125,B126,B132,B137,B138,B17,B18,B21,B23,B24,B31,B32,B34,B38,B39,B42,B46,B47,B49,B5,B50,B59,B62,B68,B7,B71,B77,B81,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B93,B95,B99,C1,C14,C27,C3,C31,C32,C44,C53,C54,C55,C56,C68,C71,C73,C74,C77,C78,C8,C86,D3,D7,D8 |
Chr2:8133188 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B80,C34,C35,C40 |
Chr2:8133191 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B68 |
Chr2:8133199 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。