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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000590`

染色体: Chr02 坐标: 8462117-8462620 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000590`
名称	SmilChr02G000590
描述	uncharacterized SmilChr02G000590
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8462117 - 8462620 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007951`
GeneID	`131007951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007951`
原始查询	`SmilChr02G000590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=low
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=34.2; qcov=0.437; evalue=9.2e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790844.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790844.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790844.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790844.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8462120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B49
`Chr2:8462129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B7,C11,C69
`Chr2:8462149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A22,B37,B6,C36,C53,C63,C64,C66
`Chr2:8462156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,C32,C68,C71
`Chr2:8462158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:8462182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:8462187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:8462196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C53,C64,C66
`Chr2:8462236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B2
`Chr2:8462250`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C49
`Chr2:8462250`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C49
`Chr2:8462255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790844.1

167 aa

167

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 26-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790844.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	26	118	1.4e-06	29.6	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934861.1
ATGGGCGAAAGTGTTTCGGCTATGATCCAATGGAAGTTACCCAAAAAGCGGAAGGATCCGGGAATGTTTACCATTTCGTGCAACATTGGTGGAACAAACATGGATAAAGCGATGATGGACTTGGGAGCTTCCATAAATGTGATGCCATTGGCCGTTTATAAGAGGTTGAACATTGGGAAAATGAGAAATACCCGTGTGGTCATACAGTTGGCCGATAGATCTAAAGCATATCCTGAAGGAATGGTAGAGGACGTACTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007951
ATGGGCGAAAGTGTTTCGGCTATGATCCAATGGAAGTTACCCAAAAAGCGGAAGGATCCGGGAATGTTTACCATTTCGTGCAACATTGGTGGAACAAACATGGATAAAGCGATGATGGACTTGGGAGCTTCCATAAATGTGATGCCATTGGCCGTTTATAAGAGGTTGAACATTGGGAAAATGAGAAATACCCGTGTGGTCATACAGTTGGCCGATAGATCTAAAGCATATCCTGAAGGAATGGTAGAGGACGTACTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790844.1
MGESVSAMIQWKLPKKRKDPGMFTISCNIGGTNMDKAMMDLGASINVMPLAVYKRLNIGKMRNTRVVIQLADRSKAYPEGMVEDVLIKVGDLIFPADFYVLDTGPETGENVILLGRPFMMTAGTKIDMKTGILTCKFDGVQEEFNIYETMKRKQEMETVDMIDCSSH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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