当前解析结果
SmilChr02G000591| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000591 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000591 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000591 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 8465855 - 8466898 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007952 |
|---|---|
| GeneID | 131007952 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007952 |
| 原始查询 | SmilChr02G000591 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007952 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790845.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057790845.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057790845.1 |
| 4 | Nucleolar fibrillar center | Nucleolar fibrillar center | 0.20000 | XP_057790845.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790845.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:8465856 |
T |
TGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 31 | A16,A3,B1,B101,B111,B120,B139,B22,B23,B3,B30,B33,B34,B37,B40,B41,B44,B58,B61,B66,B67,B69,B75,B76,B81,C10,C14,C15,C25,C45,C80 |
Chr2:8465860 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B31,C22,C30,C87 |
Chr2:8465881 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C86,C87 |
Chr2:8465893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B138,B96 |
Chr2:8465896 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C86,C87 |
Chr2:8465913 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D11,D7 |
Chr2:8466619 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,C11,C69 |
Chr2:8466622 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C53,C64 |
Chr2:8466627 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,C72 |
Chr2:8466633 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,B91 |
Chr2:8466647 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | A18,A21,B12,B2,B28,B32,B36,B49,B79,B80,B82,B88,B95,B98,C18,C40,C50,C71,C73,C86,C87,D11,D4,D5 |
Chr2:8466656 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 63 | A1,A14,A16,A2,A24,A9,B10,B103,B112,B115,B119,B121,B126,B127,B130,B133,B135,B138,B14,B140,B15,B19,B2,B23,B25,B34,B37,B42,B43,B45,B48,B5,B55,B61,B65,B7,B72,B80,B81,B90,B92,B93,B95,C12,C13,C26,C28,C31,C32,C40,C43,C54,C60,C61,C68,C72,C74,C80,C85,C87,D11,D2,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。