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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000604`

染色体: Chr02 坐标: 8809526-8811807 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000604`
名称	SmilChr02G000604
描述	glutathione S-transferase T3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8809526 - 8811807 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007962`
GeneID	`131007962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007962`
原始查询	`SmilChr02G000604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T3-like
产物	glutathione S-transferase T3-like
Arabidopsis	`AT5G41220` (GSTT3) glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=26.2; qcov=0.429; evalue=1.34e-12; confidence=low
Rice	`Os08g0225900` - identity=28.9; qcov=0.847; evalue=1.59e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790852.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790852.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790852.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790852.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8809544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B29,B50,C23,C57
`Chr2:8809574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:8809577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:8809586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B79
`Chr2:8809607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:8809622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B53
`Chr2:8809626`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	86	A10,A11,A13,A16,A20,A21,A23,A25,A3,A6,A8,B103,B104,B106,B109,B110,B111,B117,B119,B125,B127,B128,B129,B132,B133,B137,B17,B18,B20,B22,B26,B3,B33,B35,B36,B37,B47,B5,B53,B55,B61,B63,B64,B67,B68,B78,B8,B85,B86,B90,B92,B99,C10,C14,C16,C18,C21,C26,C27,C29,C3,C33,C36,C37,C38,C42,C44,C46,C5,C50,C51,C52,C56,C57,C69,C72,C73,C79,C84,D1,D10,D11,D3,D6,D7,D9
`Chr2:8809641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B117,B133
`Chr2:8809642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C46,D11
`Chr2:8809646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B7,C45,C48
`Chr2:8809647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C46,C81
`Chr2:8809649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B58,C27,C43,C55,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790852.1

294 aa

147

294

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 166-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790852.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	166	291	4.1e-08	34.9	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934869.1
ATGGATCGTGAATTCGATGAATACCTCGAGCAACAAGGCGGAACGAGGCTTCCAATGATGGGGTTTGCTCCATTTTCACAAGCCTCCAATGTCTTGGCTACGGGAAATGTTCCTACGCCGGCGGCGAACGCCAACGTTCAAGAAGAGCCGGAGGAGGTGAAGCCGAAAGCCAAGGGCACCCGCGCTGCATATTCTAGCGAGGAGTCCGAGCTCGTGGCAATATTGTGGGCGGAGGCAACCCACAATCCTATTTTGGGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007962
ATGGATCGTGAATTCGATGAATACCTCGAGCAACAAGGCGGAACGAGGCTTCCAATGATGGGGTTTGCTCCATTTTCACAAGCCTCCAATGTCTTGGCTACGGGAAATGTTCCTACGCCGGCGGCGAACGCCAACGTTCAAGAAGAGCCGGAGGAGGTGAAGCCGAAAGCCAAGGGCACCCGCGCTGCATATTCTAGCGAGGAGTCCGAGCTCGTGGCAATATTGTGGGCGGAGGCAACCCACAATCCTATTTTGGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790852.1
MDREFDEYLEQQGGTRLPMMGFAPFSQASNVLATGNVPTPAANANVQEEPEEVKPKAKGTRAAYSSEESELVAILWAEATHNPILGTSKKLLQYWGALAEKFNAPNTSGAPPRKPDHLKSHFARVQKETKFFEGFYNTCKDNWGSGMSDDQIFQQAQTMFEANFKKQFSYVKAWKVLRDCQRFTSQAGDVHSAKKPKGSDGGATTTSSEPSVTARPQGQKAAKRDMGKAKKGEGSSGGGSAFSDALEKVAESMREHAFKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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