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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000610`

染色体: Chr02 坐标: 8918479-8918931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000610`
名称	SmilChr02G000610
描述	uncharacterized SmilChr02G000610
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8918479 - 8918931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007964`
GeneID	`131007964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007964`
原始查询	`SmilChr02G000610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsPDF1.2; symbol=OsPDF1.2; hit=Os02g0212100; species=rice; confidence=low
产物	OsPDF1.2; symbol=OsPDF1.2; hit=Os02g0212100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02140` (LCR72) low-molecular-weight cysteine-rich 72 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814745] identity=51.1; qcov=0.313; evalue=5.23e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0212100` (OsPDF1.2) - identity=44.4; qcov=0.36; evalue=3.16e-10; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00304 (Gamma-thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790854.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790854.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790854.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790854.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8918550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:8918680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,C43,C46,C5
`Chr2:8918693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B91,C82,D11
`Chr2:8918694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,C43,C46,C5
`Chr2:8918707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:8918729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:8918770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr2:8918785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr2:8918804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:8918849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:8918856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:8918872`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790854.1

150 aa

150

Gamma-thionin

PF00304 Gamma-thionin 15-58 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790854.1`	Pfam	`PF00304`	Gamma-thionin	Domain	15	58	4.8e-13	49.9	Gamma-thionin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934871.1
ATGAATGCAGAGGAGATGATGACAATGCTAGGTGAGGCTGCTCTATGTGAGGCACCTAGCAGATTATTCAGGGGTGCTTGCTTGAGTAACAGAAATTGTGCAAATATTTGTGAGAAAGAAGGATTTTTGAATGGACGGTGCAAAGTCTTAAAATGCAAATGTACTAAGGATTGTAACGGGGGAGGAGGAGGTGAAGGCAGAGGTGGAGCCGGTGGCGACGGACCTCCAGGTGGAGGTCCACCAGATAGCAGTGGTAGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007964
ATGAATGCAGAGGAGATGATGACAATGCTAGGTGAGGCTGCTCTATGTGAGGCACCTAGCAGATTATTCAGGGGTGCTTGCTTGAGTAACAGAAATTGTGCAAATATTTGTGAGAAAGAAGGATTTTTGAATGGACGGTGCAAAGTCTTAAAATGCAAATGTACTAAGGATTGTAACGGGGGAGGAGGAGGTGAAGGCAGAGGTGGAGCCGGTGGCGACGGACCTCCAGGTGGAGGTCCACCAGATAGCAGTGGTAGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790854.1
MNAEEMMTMLGEAALCEAPSRLFRGACLSNRNCANICEKEGFLNGRCKVLKCKCTKDCNGGGGGEGRGGAGGDGPPGGGPPDSSGSPPGEGPPAGSDEPPSEDPPSEGPPSDGTPPTESPPGSGDGPPKTPNGGPPCDHGPPSGGPSERN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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