当前解析结果
SmilChr02G000616| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000616 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000616 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000616 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 8978109 - 8984463 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012951 |
|---|---|
| GeneID | 131012951 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012951 |
| 原始查询 | SmilChr02G000616 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | P0681F05.121-1; symbol=P0681F05.121-1; hit=Os07g0530700; species=rice; confidence=low |
| 产物 | P0681F05.121-1; symbol=P0681F05.121-1; hit=Os07g0530700; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G21215 (AT4G21215)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827870] identity=31.9; qcov=1.13; evalue=6.58e-11; confidence=low |
| Rice | Os07g0530700 (P0681F05.121-1)- identity=56.4; qcov=0.325; evalue=5.18e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012951 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057796916.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057796916.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796916.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796916.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796916.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:8983194 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:8984111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,A9,B36,B99,C14 |
Chr2:8984119 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:8984137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,C74 |
Chr2:8984153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,C45,C61,C76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。